More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0863 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0863  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
430 aa  873    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  91.39 
 
 
432 aa  783    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1670  FAD dependent oxidoreductase  51.25 
 
 
411 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3794  FAD dependent oxidoreductase  51.25 
 
 
411 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3537  oxidoreductase  38.68 
 
 
427 aa  257  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.314766  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  39.45 
 
 
401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2348  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 
401 aa  250  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4610  FAD dependent oxidoreductase  40.05 
 
 
409 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4211  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 
401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3761  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 
402 aa  225  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05617  FAD dependent oxidoreductase, putative  34.5 
 
 
417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6458  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 
402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1232  hypothetical protein  29.72 
 
 
397 aa  203  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1332  hypothetical protein  29.72 
 
 
397 aa  203  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1209  oxidoreductase  29.4 
 
 
397 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1407  hypothetical protein  29.47 
 
 
397 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1211  oxidoreductase  29.53 
 
 
397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1233  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 
397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3974  hypothetical protein  29.78 
 
 
397 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1431  hypothetical protein  29.78 
 
 
397 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4319  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
399 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1370  hypothetical protein  29.95 
 
 
398 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0253561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1472  hypothetical protein  29.03 
 
 
397 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3195  oxidoreductase  27.3 
 
 
405 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1311  FAD dependent oxidoreductase  34.45 
 
 
420 aa  180  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3187  oxidoreductase, putative  26.77 
 
 
405 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.70562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3172  oxidoreductase  26.77 
 
 
405 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  25.3 
 
 
508 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 
510 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 
428 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  24.16 
 
 
508 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  24.82 
 
 
508 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  24.82 
 
 
508 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 
434 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  23.92 
 
 
508 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
514 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  22.22 
 
 
508 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
430 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
433 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
426 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  24.3 
 
 
479 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  23.35 
 
 
508 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  23.76 
 
 
508 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  23.76 
 
 
508 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 
506 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  23.92 
 
 
508 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  26.95 
 
 
439 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
423 aa  98.6  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  25 
 
 
437 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  22.3 
 
 
508 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 
430 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  26.4 
 
 
439 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 
421 aa  96.7  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 
431 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  27.85 
 
 
430 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 
427 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  27.85 
 
 
430 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  27.85 
 
 
430 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  27.02 
 
 
430 aa  94.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  25.93 
 
 
435 aa  94.4  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 
437 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  26.18 
 
 
438 aa  93.6  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 
531 aa  93.2  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  25.13 
 
 
427 aa  92.8  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  25.71 
 
 
428 aa  92.8  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 
424 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 
435 aa  92.8  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 
434 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 
428 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0799  oxidoreductase  26.4 
 
 
427 aa  90.9  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 
433 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 
428 aa  90.9  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  24.94 
 
 
430 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
430 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 
428 aa  90.5  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  23.85 
 
 
428 aa  90.1  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  24.06 
 
 
435 aa  90.1  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 
435 aa  90.1  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  24.42 
 
 
426 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 
426 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  24.02 
 
 
426 aa  89.7  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
428 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
428 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  27.01 
 
 
468 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  27.96 
 
 
468 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  27.96 
 
 
468 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 
433 aa  89.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 
433 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  24.42 
 
 
426 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
428 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  24.16 
 
 
426 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 
426 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  24.68 
 
 
426 aa  89  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  24.16 
 
 
426 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 
424 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
428 aa  88.6  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  24.16 
 
 
426 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 
435 aa  87.8  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 
436 aa  87.8  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  25.58 
 
 
428 aa  87  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>