74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2864 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2604  FAD dependent oxidoreductase  86.96 
 
 		 391 aa  678    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2864  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 391 aa  785    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2901  sarcosine oxidase  57.8 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2102  FAD dependent oxidoreductase  52.53 
 
 		 395 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2605  FAD dependent oxidoreductase  47.85 
 
 		 395 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2865  FAD dependent oxidoreductase  48.1 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94246  predicted protein  28.61 
 
 		 410 aa  102  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0800134  normal  0.0557343 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  27.6 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  29.22 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  25.72 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  25.32 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  23.32 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  27.49 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  25.41 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  25.33 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  25.61 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  25.41 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  27.34 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  22.96 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  25.32 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  24.55 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  23.44 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  26.94 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  25.59 
 
 		 375 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  26.18 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  23.94 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  23.94 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  23.94 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  23.79 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  22.89 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  22.89 
 
 		 443 aa  63.2  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  26.55 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  26.55 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  26.55 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  26.55 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  26.55 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  26.55 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  25.19 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  26.55 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  26.11 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  26.11 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  29.94 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  25.45 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  25.47 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  24.2 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  24.08 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  24.48 
 
 		 383 aa  53.5  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  25.34 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  25.11 
 
 		 372 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  21.38 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  25.95 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  25.11 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  25.11 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  25.11 
 
 		 372 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  25.11 
 
 		 372 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  23.86 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  25.78 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  27.35 
 
 		 382 aa  43.5  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.1 
 
 		 390 aa  43.5  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 432 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  24.2 
 
 		 375 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>