207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3166 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  80.88 
 
 		 386 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  100 
 
 		 391 aa  802    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  66.75 
 
 		 391 aa  531  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  64.78 
 
 		 391 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  49.74 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  49.48 
 
 		 390 aa  361  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  50.78 
 
 		 391 aa  357  9.999999999999999e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  47.92 
 
 		 391 aa  332  8e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  44.42 
 
 		 385 aa  315  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  38.32 
 
 		 395 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  38.76 
 
 		 381 aa  236  8e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  37.44 
 
 		 381 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  36.69 
 
 		 381 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  36.69 
 
 		 381 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  35.92 
 
 		 443 aa  213  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  35.41 
 
 		 390 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  36.81 
 
 		 378 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  35.66 
 
 		 428 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  33.85 
 
 		 376 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  35.75 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  32.32 
 
 		 373 aa  196  6e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  32.66 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  32.66 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  32.66 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  33.51 
 
 		 375 aa  190  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  33.59 
 
 		 372 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  33.84 
 
 		 372 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  32.9 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  33.84 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  33.84 
 
 		 372 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  33.84 
 
 		 372 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  32.73 
 
 		 372 aa  186  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  33.16 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  33.16 
 
 		 372 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  33.16 
 
 		 372 aa  182  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  33.16 
 
 		 372 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  34.72 
 
 		 376 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  33.16 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  33.16 
 
 		 372 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  32.64 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  32.9 
 
 		 372 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  33.16 
 
 		 372 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  33.16 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  32.82 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  31.99 
 
 		 371 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  33.07 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 379 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 363 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  30.38 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  30.34 
 
 		 382 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  31.37 
 
 		 352 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  25.84 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  29.34 
 
 		 452 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  24.49 
 
 		 394 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  27.35 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  29.73 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  27.59 
 
 		 397 aa  96.3  8e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  28.87 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  26.89 
 
 		 366 aa  94.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 372 aa  92  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  27.3 
 
 		 396 aa  90.5  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  28.23 
 
 		 376 aa  89.7  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  27.25 
 
 		 367 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2865  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  22.7 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.61 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2605  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 395 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  24.94 
 
 		 615 aa  76.6  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2901  sarcosine oxidase  30.29 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  23.65 
 
 		 398 aa  72.8  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2604  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2864  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  25.19 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  23.72 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  25.8 
 
 		 984 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  23.02 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 983 aa  63.9  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 		 799 aa  62.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53135  predicted protein  23.17 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0768437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  23.02 
 
 		 816 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  23.67 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  24.14 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>