240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0471 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  100 
 
 		 443 aa  898    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  99.74 
 
 		 428 aa  763    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  63.83 
 
 		 376 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  62.67 
 
 		 377 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  57.41 
 
 		 381 aa  439  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  58.24 
 
 		 376 aa  437  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  45.99 
 
 		 379 aa  329  8e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  47.26 
 
 		 381 aa  315  9e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  47.34 
 
 		 375 aa  293  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  46.17 
 
 		 379 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  43.7 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  43.7 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  42.93 
 
 		 381 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  41.82 
 
 		 378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  41.67 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  40.98 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  37.34 
 
 		 379 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  37.56 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  37.5 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  36.27 
 
 		 391 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  36.73 
 
 		 391 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  36.99 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  35.48 
 
 		 386 aa  216  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  35.92 
 
 		 391 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  38.48 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  36.39 
 
 		 395 aa  210  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  33.33 
 
 		 371 aa  204  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  33.33 
 
 		 371 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  33.33 
 
 		 371 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  33.68 
 
 		 373 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  35.62 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  33.25 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  35.86 
 
 		 390 aa  192  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  33.33 
 
 		 372 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  33.07 
 
 		 372 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  33.86 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  33.86 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  33.86 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  33.6 
 
 		 372 aa  184  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  33.07 
 
 		 372 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  33.6 
 
 		 372 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  33.07 
 
 		 372 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  33.6 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  33.6 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  33.07 
 
 		 372 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  33.33 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  34.28 
 
 		 372 aa  181  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  33.07 
 
 		 372 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  34.04 
 
 		 394 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  32.88 
 
 		 380 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  33.07 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  32.41 
 
 		 382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  28.86 
 
 		 452 aa  130  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  30.75 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  32.54 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  32.66 
 
 		 352 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 		 355 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 422 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  29.3 
 
 		 366 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  30.43 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 398 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  27.59 
 
 		 367 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  27.39 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  25.68 
 
 		 394 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 367 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  27.92 
 
 		 397 aa  86.7  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 		 374 aa  86.7  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04975  fructosyl amino acid oxidasesarcosine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10130)  25.76 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.656567 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  23.86 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  25.26 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  25.42 
 
 		 615 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 984 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  24.24 
 
 		 983 aa  74.7  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 500 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 		 823 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.88 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2604  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>