57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2605 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2605  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 395 aa  800    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2865  FAD dependent oxidoreductase  90.63 
 
 		 397 aa  730    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2901  sarcosine oxidase  49.36 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2864  FAD dependent oxidoreductase  47.85 
 
 		 391 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2604  FAD dependent oxidoreductase  46.84 
 
 		 391 aa  350  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2102  FAD dependent oxidoreductase  47.85 
 
 		 395 aa  312  7.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  29.92 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  28.32 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94246  predicted protein  26.29 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0800134  normal  0.0557343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  30.04 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  28.01 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  27.87 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  26.96 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  26.12 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  26.84 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  26.44 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  26.44 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  26.04 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  23.53 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  23.53 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  23.53 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  24.78 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  22.75 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  25.81 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  29.89 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  27.49 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  26.97 
 
 		 385 aa  53.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  28.02 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  29.72 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  21.72 
 
 		 371 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  27.75 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  21.81 
 
 		 363 aa  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  27.01 
 
 		 383 aa  49.7  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  28.04 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  22.86 
 
 		 815 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 434 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  24.24 
 
 		 835 aa  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  25.94 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  23.96 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 		 837 aa  47  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  23.81 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  23.47 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  24.77 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  23.36 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  23.82 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  21.91 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  22.57 
 
 		 372 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  22.69 
 
 		 805 aa  44.3  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  23.61 
 
 		 806 aa  43.9  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  22.17 
 
 		 816 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  22.57 
 
 		 372 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  22.57 
 
 		 372 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>