261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1558 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  100 
 
 		 394 aa  811    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 379 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  36.55 
 
 		 376 aa  216  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  37.43 
 
 		 383 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  36.27 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  35.51 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  36.02 
 
 		 381 aa  203  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  35.77 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  34.11 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  36.97 
 
 		 377 aa  192  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  33.16 
 
 		 379 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  34.36 
 
 		 443 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  34.36 
 
 		 428 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  32.91 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  35.42 
 
 		 384 aa  182  8.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  31.88 
 
 		 389 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  29.41 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  33.25 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  32.47 
 
 		 391 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  33.68 
 
 		 390 aa  170  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  32.74 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  31.44 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  31.35 
 
 		 381 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  31.35 
 
 		 381 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  34.22 
 
 		 380 aa  159  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  31.22 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  29.06 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  31.4 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  30.37 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  30.37 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  30.37 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  27.94 
 
 		 372 aa  149  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  27.94 
 
 		 372 aa  149  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  27.94 
 
 		 372 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  27.94 
 
 		 372 aa  149  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  27.94 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  27.94 
 
 		 372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  27.94 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  27.94 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  27.94 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  28.2 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  27.68 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  27.94 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  27.94 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  27.94 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  29.43 
 
 		 373 aa  147  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  28.61 
 
 		 391 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  28.64 
 
 		 386 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  28.01 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  27.55 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  32.59 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  31.87 
 
 		 366 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  28.96 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  30.52 
 
 		 352 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  26.58 
 
 		 391 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  30.49 
 
 		 392 aa  123  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  29.64 
 
 		 389 aa  113  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  27.37 
 
 		 397 aa  100  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 398 aa  99.8  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 398 aa  99.8  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  26.92 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  23.47 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 		 367 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  23.54 
 
 		 363 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  25.88 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  27.87 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  23.37 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  23.78 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  24.85 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  22.25 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  24.11 
 
 		 983 aa  77.4  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  22.92 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  24.82 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  25.06 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  25.06 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  25.06 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  25.06 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  22.61 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 		 392 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  24.7 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  23.8 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  23.43 
 
 		 984 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>