197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0194 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  89.32 
 
 		 367 aa  675    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  100 
 
 		 367 aa  752    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  29.97 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  28.69 
 
 		 390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  27.73 
 
 		 377 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  28.23 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  26.32 
 
 		 376 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  28.84 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  25.56 
 
 		 381 aa  99.8  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 363 aa  99.8  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  26.69 
 
 		 376 aa  99.8  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  25.41 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  27.59 
 
 		 428 aa  93.2  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  24.86 
 
 		 389 aa  92.8  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  27.59 
 
 		 443 aa  92.8  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  29.55 
 
 		 376 aa  92  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  26.24 
 
 		 386 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  27.45 
 
 		 391 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  25.73 
 
 		 391 aa  89.4  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 		 422 aa  89.4  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  27.25 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  23.32 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  23.55 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  27.61 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  27.09 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  26.01 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  26.8 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  26.8 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28.33 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  27.39 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  25.84 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  21.94 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  25.28 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  21.94 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  21.94 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05050  conserved hypothetical protein  25.94 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  25.42 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  25.33 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3625  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  28 
 
 		 366 aa  75.9  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  28.49 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  22.28 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  23.55 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  25.7 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  21.94 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  25.07 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  24.21 
 
 		 615 aa  67.4  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  24.11 
 
 		 382 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  29.86 
 
 		 396 aa  67  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04975  fructosyl amino acid oxidasesarcosine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10130)  26.41 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.656567 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00040  expressed protein  24.35 
 
 		 520 aa  66.6  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  26.89 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  21.07 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 399 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53135  predicted protein  23.58 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0768437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  22.22 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  22.22 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  22.22 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 376 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  22.34 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  22.16 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  22.16 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  22.16 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  22.31 
 
 		 372 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  22.93 
 
 		 452 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  22.31 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  22.31 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  22.31 
 
 		 372 aa  56.2  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  27.23 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  21.94 
 
 		 372 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  21.7 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  21.26 
 
 		 478 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06647  conserved hypothetical protein  22.68 
 
 		 440 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  29.28 
 
 		 392 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  22.1 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 374 aa  53.5  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0332  FAD dependent oxidoreductase  21.71 
 
 		 445 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  21.8 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 471 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06690  expressed protein  22.12 
 
 		 504 aa  50.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.244503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 		 401 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 374 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 375 aa  50.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 382 aa  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4708  D-amino-acid dehydrogenase  60 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 		 428 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  24 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>