208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4345 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
363 aa  754    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  40.76 
 
 
422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 
402 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  30.36 
 
 
389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  28.77 
 
 
386 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  30.71 
 
 
378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  29.41 
 
 
381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  30.21 
 
 
391 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  29.32 
 
 
391 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  30.03 
 
 
381 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  30.03 
 
 
381 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  29.03 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  25.47 
 
 
385 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  29.04 
 
 
391 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  26.88 
 
 
379 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  28.07 
 
 
375 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  30.75 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 
379 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  28.91 
 
 
395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  27.09 
 
 
443 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  27.09 
 
 
428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  26.87 
 
 
371 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  26.87 
 
 
371 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  26.87 
 
 
371 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  28.72 
 
 
389 aa  126  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  29.01 
 
 
376 aa  125  9e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  27.82 
 
 
376 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  29.47 
 
 
390 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  28.84 
 
 
391 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  27.07 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  28.73 
 
 
381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  28.57 
 
 
383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  24.44 
 
 
371 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  27.01 
 
 
390 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  26.37 
 
 
377 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  26.02 
 
 
372 aa  112  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.596756 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  28.17 
 
 
428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  26.6 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  25.81 
 
 
372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  25.81 
 
 
372 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  25.81 
 
 
372 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 
384 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  24.86 
 
 
372 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  25.54 
 
 
372 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  25.74 
 
 
372 aa  103  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  25.74 
 
 
372 aa  103  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  25.74 
 
 
372 aa  103  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  25.74 
 
 
372 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  25.47 
 
 
372 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  25.47 
 
 
372 aa  102  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  25.47 
 
 
372 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  25.47 
 
 
372 aa  102  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  25.54 
 
 
372 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  28.42 
 
 
380 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  25 
 
 
367 aa  99.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  28.02 
 
 
389 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  26.3 
 
 
392 aa  94  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 
372 aa  93.6  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  25.24 
 
 
478 aa  92.8  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  23.63 
 
 
615 aa  92.8  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  28.16 
 
 
352 aa  89.7  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  26.78 
 
 
382 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06690  expressed protein  22.15 
 
 
504 aa  89.4  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.244503  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 
400 aa  87  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25 
 
 
399 aa  86.7  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  23.12 
 
 
394 aa  85.9  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05050  conserved hypothetical protein  23.66 
 
 
456 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  24.16 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  26.75 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53135  predicted protein  24.41 
 
 
432 aa  79  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0768437  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  25.77 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  23 
 
 
452 aa  69.7  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  24.22 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  25.52 
 
 
397 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 
399 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  21.83 
 
 
387 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00040  expressed protein  21.64 
 
 
520 aa  64.3  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  23.5 
 
 
401 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04975  fructosyl amino acid oxidasesarcosine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10130)  37.5 
 
 
441 aa  62.8  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.656567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  27.92 
 
 
382 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 
385 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08982  hypothetical fructosyl amine:oxygen oxidoreductase (Eurofung)  39.34 
 
 
438 aa  60.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  23.95 
 
 
375 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  23.82 
 
 
386 aa  60.1  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2901  sarcosine oxidase  22.31 
 
 
397 aa  60.1  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 
374 aa  60.1  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  23 
 
 
398 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  24.24 
 
 
398 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  24.24 
 
 
398 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  23.36 
 
 
375 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 
375 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  22.28 
 
 
387 aa  57  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  24.24 
 
 
398 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  21.08 
 
 
398 aa  56.6  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05930  Peroxisomal sarcosine oxidase, putative  23.06 
 
 
448 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  28.75 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 
395 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>