151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2073 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 372 aa  734    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  40.61 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  39.78 
 
 		 367 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  30.65 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  32.45 
 
 		 389 aa  123  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  28.97 
 
 		 381 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  28.42 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  31.78 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  30.14 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  30.63 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  30.14 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  28.72 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  24.38 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  25.42 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  25.42 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  25.42 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  27.12 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  27.15 
 
 		 376 aa  97.4  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  27.25 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  26.87 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 363 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  28.57 
 
 		 390 aa  93.2  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 384 aa  92.8  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  24.73 
 
 		 371 aa  92.8  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  26.42 
 
 		 381 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  26.42 
 
 		 381 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  25.38 
 
 		 391 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  24.73 
 
 		 386 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  26.87 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  26.36 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  25.73 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 402 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  29.94 
 
 		 379 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  26.33 
 
 		 381 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  27.73 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  27.91 
 
 		 383 aa  86.3  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  27.66 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  27.14 
 
 		 615 aa  83.2  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  25.7 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  24.93 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  26.14 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  25.2 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  25.2 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  25 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  25.2 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  26.63 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  25.83 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  24.93 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  23.63 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  25.07 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  25.07 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  25.07 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04975  fructosyl amino acid oxidasesarcosine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10130)  26.32 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.656567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  23.31 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  23.24 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  23.35 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  25.2 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  23.35 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  23.35 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  28.14 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  21.99 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  27.02 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  27.49 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28.37 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3625  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  25.68 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  27.59 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00040  expressed protein  23.18 
 
 		 520 aa  57  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 812 aa  56.2  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  25.28 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53135  predicted protein  20.43 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0768437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 500 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 500 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 496 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 		 471 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3264  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 427 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  26.26 
 
 		 335 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05050  conserved hypothetical protein  23.87 
 
 		 456 aa  50.1  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2572  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 		 407 aa  49.7  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  26.13 
 
 		 460 aa  49.7  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 513 aa  49.7  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  23.22 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  24.14 
 
 		 433 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  23.06 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.34 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  27.99 
 
 		 352 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 445 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 442 aa  47.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 433 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 430 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>