207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7077 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  89.32 
 
 		 367 aa  675    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 367 aa  750    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  39.78 
 
 		 372 aa  249  7e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  30.56 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  29.23 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  29.17 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  26.16 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  26.8 
 
 		 376 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  27.7 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  29.33 
 
 		 391 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  29.41 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  26.94 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  26.5 
 
 		 395 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  25.82 
 
 		 391 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  29 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  24.36 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  24.73 
 
 		 373 aa  90.1  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  25.35 
 
 		 389 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  25.28 
 
 		 428 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  25.28 
 
 		 443 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  26.4 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  25.68 
 
 		 391 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  23.12 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  25.56 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  25.84 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  23.99 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  25.07 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.7 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  28.12 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  26.08 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  22.99 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05050  conserved hypothetical protein  25.44 
 
 		 456 aa  76.3  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  22.25 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  22.25 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  25.35 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  28.29 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  25.35 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  22.25 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  25.07 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3625  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  22.06 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  31.28 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  25.75 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  27.71 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  22.25 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  24.11 
 
 		 615 aa  70.1  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  25.54 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  26.63 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04975  fructosyl amino acid oxidasesarcosine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10130)  26.65 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.656567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  24.3 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  20.74 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  22.31 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  22.31 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  22.31 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  22.31 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53135  predicted protein  22.49 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0768437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  24.92 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  20.83 
 
 		 372 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  20.83 
 
 		 372 aa  57  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  21.11 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  20.83 
 
 		 372 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  22.04 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  22.34 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06690  expressed protein  21.27 
 
 		 504 aa  56.2  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.244503  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  21.07 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 436 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  21.07 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  21.07 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  22.04 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  21.53 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  23.14 
 
 		 452 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 		 433 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  30.04 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 376 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 427 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 496 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0332  FAD dependent oxidoreductase  22.69 
 
 		 445 aa  53.1  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  19.68 
 
 		 478 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 500 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 500 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 427 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  25.89 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  25.07 
 
 		 427 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 		 382 aa  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 427 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  25 
 
 		 382 aa  49.7  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06647  conserved hypothetical protein  22.93 
 
 		 440 aa  49.7  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  24.12 
 
 		 395 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 		 433 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  22.89 
 
 		 433 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>