More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4345 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  100 
 
 
380 aa  756    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  44.5 
 
 
399 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  48.27 
 
 
352 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  45.28 
 
 
376 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  44.35 
 
 
366 aa  259  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  41.56 
 
 
392 aa  223  6e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  36.81 
 
 
389 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 
379 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  36.44 
 
 
376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  35.41 
 
 
381 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  35.41 
 
 
381 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  35.41 
 
 
381 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  34.58 
 
 
381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 
384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  34.27 
 
 
394 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  35.54 
 
 
374 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  34.56 
 
 
378 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  35.14 
 
 
376 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  33.95 
 
 
443 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  33.95 
 
 
428 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  34.55 
 
 
390 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  32.26 
 
 
389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  35.83 
 
 
383 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  32.75 
 
 
391 aa  153  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  34.26 
 
 
375 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  35.6 
 
 
377 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  34.56 
 
 
390 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  33.84 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  33.51 
 
 
381 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  32.97 
 
 
379 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  29.92 
 
 
371 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  29.92 
 
 
371 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  29.92 
 
 
371 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  29.97 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  27.6 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  31.27 
 
 
379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  33.42 
 
 
391 aa  133  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  28 
 
 
373 aa  132  9e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  29.3 
 
 
371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  27.08 
 
 
372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  27.63 
 
 
391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  28.34 
 
 
372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 
402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  27.08 
 
 
372 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  27.08 
 
 
372 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  26.54 
 
 
372 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  26.81 
 
 
372 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  27.51 
 
 
372 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  27.51 
 
 
372 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  27.7 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  27.7 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  27.7 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  27.51 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  27.51 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  27.25 
 
 
372 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  27.25 
 
 
372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  27.86 
 
 
386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 
363 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  28.38 
 
 
391 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  28.84 
 
 
367 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  27.25 
 
 
395 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 
367 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  25.53 
 
 
394 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 
372 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  28.79 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 
376 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 
422 aa  94.4  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  28.13 
 
 
382 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  27.94 
 
 
428 aa  92.4  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 
392 aa  91.3  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  28.65 
 
 
396 aa  89.7  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 
399 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  20.47 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  24.69 
 
 
452 aa  79.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  25.84 
 
 
615 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 
430 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3533  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.972727  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4607  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  22.88 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04975  fructosyl amino acid oxidasesarcosine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10130)  26.49 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.656567 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 
496 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 
500 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 
500 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 
799 aa  69.3  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  26.87 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53135  predicted protein  23.68 
 
 
432 aa  65.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0768437  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  20.61 
 
 
372 aa  65.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 
430 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 
445 aa  64.7  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 
442 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
383 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 
387 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>