261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0224 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  83.93 
 
 		 397 aa  672    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  100 
 
 		 396 aa  810    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  51.43 
 
 		 394 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  29.26 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  30.57 
 
 		 378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  31.05 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  31.05 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  31.05 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  31.72 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  29.8 
 
 		 375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  26.56 
 
 		 372 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  30.95 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  26.99 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  26.56 
 
 		 372 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  29.74 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  26.34 
 
 		 372 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  26.29 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  27.34 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  29.31 
 
 		 376 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  27.37 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  26.67 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  25.7 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  26.41 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  25.7 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  27.13 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  25.7 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  27.3 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  27.3 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  27.3 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  27.3 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  27.3 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  28.39 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  27.58 
 
 		 372 aa  101  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  27.3 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  27.56 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  28.86 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  28.09 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  27.32 
 
 		 394 aa  98.2  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  32.59 
 
 		 352 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  30.62 
 
 		 399 aa  97.1  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  27.81 
 
 		 391 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  26.7 
 
 		 390 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  30.03 
 
 		 377 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  26.63 
 
 		 389 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  27.56 
 
 		 381 aa  92.8  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  28.02 
 
 		 428 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  28.1 
 
 		 443 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  26.75 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  30.75 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  27.37 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  29.04 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  29.33 
 
 		 383 aa  87.4  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  28.93 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  25.94 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  27.84 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  24.48 
 
 		 373 aa  76.3  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  23.95 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  25.47 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  27.72 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  27.88 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  22.28 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  24.56 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05050  conserved hypothetical protein  25.63 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 500 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  24.13 
 
 		 615 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 		 799 aa  60.8  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  29.52 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  24.2 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  24.78 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4607  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04975  fructosyl amino acid oxidasesarcosine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10130)  36.59 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.656567 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  25.23 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1990  oxidoreductase, FAD-binding  26.97 
 
 		 433 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0501  oxidoreductase, FAD-binding  26.97 
 
 		 433 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  30.8 
 
 		 367 aa  57  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0774  oxidoreductase, FAD-binding  26.97 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  24.88 
 
 		 446 aa  57  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1637  oxidoreductase, FAD-binding  26.97 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>