89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3930 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 355 aa  680    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  39.72 
 
 		 381 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  40.06 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  37.36 
 
 		 379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  34.6 
 
 		 391 aa  155  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  35.13 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  35.13 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  31.73 
 
 		 385 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  35.88 
 
 		 378 aa  153  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  33.89 
 
 		 389 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  33.7 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  33.7 
 
 		 443 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  34.28 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  34.31 
 
 		 395 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  30.05 
 
 		 391 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  30.75 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  34.42 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  31.75 
 
 		 391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  34.12 
 
 		 389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  34.14 
 
 		 390 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  30.08 
 
 		 391 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  32.87 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  32.61 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  31.51 
 
 		 376 aa  122  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  29.61 
 
 		 381 aa  119  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  34.73 
 
 		 391 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  28.49 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  27.01 
 
 		 373 aa  117  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  33.43 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  31.01 
 
 		 382 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  26.21 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  26.21 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  26.21 
 
 		 372 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  26.21 
 
 		 372 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  26.21 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  25.93 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 379 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  25.57 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 363 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  25.28 
 
 		 372 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  25.28 
 
 		 372 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  25.28 
 
 		 372 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  25.86 
 
 		 371 aa  96.3  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  25.22 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  25.22 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  25.22 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  31.79 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  25 
 
 		 372 aa  94  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  25 
 
 		 372 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  24.72 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  24.72 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  24.72 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  29.49 
 
 		 380 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 422 aa  90.9  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  24.85 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  33.24 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  27.73 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  30.09 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  25.42 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  35.21 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  28.31 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  31.5 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  21.25 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 395 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  29.97 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  29.45 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04975  fructosyl amino acid oxidasesarcosine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10130)  24.5 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.656567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4607  FAD dependent oxidoreductase  36.15 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08982  hypothetical fructosyl amine:oxygen oxidoreductase (Eurofung)  21.39 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  22.99 
 
 		 478 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  22.76 
 
 		 395 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 390 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.59 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 983 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 984 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  33.61 
 
 		 446 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  23.05 
 
 		 452 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 		 393 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 370 aa  43.5  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  23.48 
 
 		 615 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05050  conserved hypothetical protein  25.3 
 
 		 456 aa  43.5  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3539  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 470 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 388 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 372 aa  42.7  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>