267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1182 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  99.46 
 
 
372 aa  768    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  83.56 
 
 
372 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  98.66 
 
 
372 aa  764    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  98.66 
 
 
372 aa  764    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  98.66 
 
 
372 aa  763    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  99.46 
 
 
372 aa  768    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  84.1 
 
 
372 aa  658    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  100 
 
 
372 aa  773    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  83.6 
 
 
372 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  83.87 
 
 
372 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  98.92 
 
 
372 aa  764    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  83.83 
 
 
372 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  98.66 
 
 
372 aa  764    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  99.19 
 
 
372 aa  767    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  76.88 
 
 
372 aa  604  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  62.8 
 
 
371 aa  511  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  63.71 
 
 
371 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  63.71 
 
 
371 aa  503  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  63.71 
 
 
371 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  50.94 
 
 
373 aa  397  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  34.03 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  35.58 
 
 
391 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  34.12 
 
 
381 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  34.12 
 
 
381 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  36.55 
 
 
381 aa  209  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  32.89 
 
 
378 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  34.82 
 
 
381 aa  203  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  33.86 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  30.87 
 
 
385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  32.71 
 
 
375 aa  195  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  33.68 
 
 
379 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  34.39 
 
 
376 aa  193  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  29.97 
 
 
389 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  32.47 
 
 
386 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  33.16 
 
 
391 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  33.24 
 
 
443 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  32.64 
 
 
377 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  32.98 
 
 
428 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
379 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  32.17 
 
 
391 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  29.55 
 
 
379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  29.74 
 
 
390 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  28.9 
 
 
389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  29.44 
 
 
390 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  31.47 
 
 
391 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  30.75 
 
 
391 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  31.65 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  29.03 
 
 
395 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  27.76 
 
 
394 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  28.37 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  29.31 
 
 
352 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  27.45 
 
 
380 aa  109  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  30 
 
 
376 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  28.33 
 
 
389 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 
374 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 
363 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 
422 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  25 
 
 
394 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
398 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  27.25 
 
 
396 aa  93.2  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  25.65 
 
 
392 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  27.3 
 
 
366 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.53 
 
 
399 aa  87  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 
398 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  25.71 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 
372 aa  82.8  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  24.11 
 
 
478 aa  81.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  26.61 
 
 
452 aa  81.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  21.71 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  24.85 
 
 
355 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  21.21 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  23.65 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 
385 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  22.82 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  23.71 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  22.76 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  23.51 
 
 
394 aa  69.7  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00040  expressed protein  24.11 
 
 
520 aa  69.3  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  23.21 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  23.29 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  24.27 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  24.49 
 
 
615 aa  67  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  24.01 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  22.84 
 
 
385 aa  66.2  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06690  expressed protein  22.47 
 
 
504 aa  65.9  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.244503  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  24.07 
 
 
393 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2371  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 
394 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  20.98 
 
 
394 aa  63.5  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  27.4 
 
 
398 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  24.01 
 
 
446 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 
388 aa  63.2  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2604  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 
391 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>