290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6193 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  100 
 
 		 352 aa  695    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  52.66 
 
 		 399 aa  293  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  48.99 
 
 		 380 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  48.98 
 
 		 366 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  48.35 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  43.96 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  38.4 
 
 		 381 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  38.4 
 
 		 381 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  37.85 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  36.21 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  37.29 
 
 		 378 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  36.89 
 
 		 381 aa  165  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  37.16 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  36.16 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  36.27 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  35.38 
 
 		 381 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  36.39 
 
 		 383 aa  159  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  37.82 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 379 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  35 
 
 		 376 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  35.71 
 
 		 379 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  32.6 
 
 		 389 aa  149  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  37.33 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  35.44 
 
 		 428 aa  145  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  36.07 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  35.44 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  30.99 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  30.99 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  30.99 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  30.51 
 
 		 371 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  30.14 
 
 		 372 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  30.51 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  30.47 
 
 		 373 aa  141  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  29.81 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  29.49 
 
 		 372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  30.14 
 
 		 372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  29.81 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  30.14 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  36.59 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  29.49 
 
 		 372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  29.49 
 
 		 372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  29.49 
 
 		 372 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  33.42 
 
 		 391 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  30.62 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  30.62 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  30.62 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  29.49 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  29.21 
 
 		 372 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  35.48 
 
 		 390 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  30.99 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  29.62 
 
 		 385 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  31.91 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  33.06 
 
 		 389 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  30.29 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  31.55 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  33.61 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  26.81 
 
 		 394 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  32.65 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  31.04 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  33.33 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 363 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  30.48 
 
 		 391 aa  106  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  29.89 
 
 		 382 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 399 aa  93.6  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 422 aa  92  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 398 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  26.72 
 
 		 428 aa  90.5  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  29.04 
 
 		 367 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 367 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 398 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 398 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4607  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2371  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 389 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 816 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3550  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 816 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2748  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 384 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0267692  normal  0.0112002 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  25.19 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  29.12 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  26.59 
 
 		 478 aa  67  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 372 aa  67  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 806 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>