96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2865 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2865  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 397 aa  798    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2605  FAD dependent oxidoreductase  90.63 
 
 		 395 aa  730    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2901  sarcosine oxidase  49.36 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2864  FAD dependent oxidoreductase  48.1 
 
 		 391 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2604  FAD dependent oxidoreductase  47.34 
 
 		 391 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2102  FAD dependent oxidoreductase  48.86 
 
 		 395 aa  324  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  29.82 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  29.59 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94246  predicted protein  26.9 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0800134  normal  0.0557343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  30.4 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  29.15 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  27.57 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  28.04 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  27.38 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  26.51 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  24.17 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  26.12 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  27.62 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  27.08 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  24.38 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  27.08 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  23.18 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  23.18 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  23.18 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  25.07 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  29.23 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  27.43 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  25.19 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  30.84 
 
 		 397 aa  57  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  23.69 
 
 		 806 aa  57  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 816 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  22.96 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  22.97 
 
 		 837 aa  56.2  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  27.44 
 
 		 391 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 		 835 aa  56.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 816 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  22.17 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 815 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  23.94 
 
 		 376 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 		 381 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 805 aa  53.1  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  25 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  26.52 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  22.34 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  26.87 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  23.7 
 
 		 816 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  26.6 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  20.39 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  20.39 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  20.39 
 
 		 372 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 		 390 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  21.01 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 815 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  21.01 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  28.97 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  21.01 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  21.01 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  21.01 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  21.01 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  20 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  20 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  26.74 
 
 		 452 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  20.62 
 
 		 372 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  21.01 
 
 		 372 aa  47.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  21.01 
 
 		 372 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 		 374 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 384 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  26.03 
 
 		 371 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 390 aa  46.6  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  26.03 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2967  bifunctional enzyme involved in glycine degradation  26.73 
 
 		 831 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.782343 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  22.97 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 817 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  24.77 
 
 		 371 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  22.97 
 
 		 443 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 		 827 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  25.57 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  22.69 
 
 		 381 aa  43.5  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  24.77 
 
 		 383 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 		 825 aa  43.5  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 804 aa  43.5  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  27.98 
 
 		 394 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  40.98 
 
 		 434 aa  43.1  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  22.12 
 
 		 815 aa  43.1  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  29.52 
 
 		 831 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  26.97 
 
 		 376 aa  42.7  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 389 aa  42.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>