74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2604 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2604  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 391 aa  786    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2864  FAD dependent oxidoreductase  86.96 
 
 		 391 aa  678    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2901  sarcosine oxidase  56.78 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2102  FAD dependent oxidoreductase  51.01 
 
 		 395 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2865  FAD dependent oxidoreductase  47.34 
 
 		 397 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2605  FAD dependent oxidoreductase  46.84 
 
 		 395 aa  350  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  27.79 
 
 		 391 aa  99.4  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94246  predicted protein  29.18 
 
 		 410 aa  97.1  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0800134  normal  0.0557343 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  26.61 
 
 		 385 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  26.74 
 
 		 386 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  24.04 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  24.01 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  25.71 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  25.78 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  23.08 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  23.55 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  23.55 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  23.55 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  23.7 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  26.7 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  23.95 
 
 		 428 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  23.95 
 
 		 443 aa  66.6  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  24.87 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  25.92 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  24.04 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  25.59 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  26.42 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  24.62 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  26.36 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  26.36 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  26.36 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  26.36 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  26.36 
 
 		 372 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  25.28 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  26.36 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  26.36 
 
 		 372 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  25.73 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  25.26 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  25.91 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  25.91 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  24.87 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  23.87 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  23.87 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  21.66 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  22.11 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  22.36 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  25.24 
 
 		 372 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  25.24 
 
 		 372 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  25.57 
 
 		 372 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  25.57 
 
 		 372 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  22.38 
 
 		 372 aa  53.1  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  23.68 
 
 		 377 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  25.14 
 
 		 372 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  24.08 
 
 		 389 aa  49.7  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  25.52 
 
 		 375 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  29.11 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  25 
 
 		 383 aa  43.9  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 		 374 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>