More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2449 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
351 aa  719    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 
390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5087  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 
349 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5880  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0408226  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0176  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 
373 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1979  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 
373 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2536  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
364 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5125  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 
378 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78521  normal  0.0962359 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2618  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 
403 aa  99.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5548  oxidoreductase  26.32 
 
 
373 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5421  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 
378 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594548  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27740  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.2 
 
 
388 aa  97.1  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0576  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 
365 aa  89.7  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00335958  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1878  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 
379 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7399  oxidoreductase  27.84 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  29.86 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  25.58 
 
 
446 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  26.46 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  26.46 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  26.46 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 
423 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  26.46 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 
446 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 
442 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
442 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 
446 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  27.97 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 
983 aa  72  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  23.85 
 
 
984 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
385 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  26.07 
 
 
436 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  30.84 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
799 aa  70.5  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  25.23 
 
 
405 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  22.55 
 
 
960 aa  68.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2431  D-amino-acid dehydrogenase  22.46 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  29.3 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 
441 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1127  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46832  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  22.47 
 
 
385 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  28.57 
 
 
369 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 
444 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  28.77 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 
500 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  29.08 
 
 
365 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 
415 aa  65.9  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 
444 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 
365 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
379 aa  65.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 
390 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 
500 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1813  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 
417 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  28.31 
 
 
369 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.84 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 
455 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  25.23 
 
 
496 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 
365 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 
424 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  28.97 
 
 
389 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 
387 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 
393 aa  63.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  25.95 
 
 
371 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
375 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1793  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 
389 aa  63.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.075637  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
375 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
375 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.11 
 
 
417 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  27.65 
 
 
369 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 
367 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  27.65 
 
 
369 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  28.05 
 
 
369 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0520  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 
369 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  29.73 
 
 
381 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  29.73 
 
 
381 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  27.65 
 
 
369 aa  62.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4207  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
359 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.81852  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 
444 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  20.84 
 
 
393 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
386 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 
363 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  24.15 
 
 
382 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  26.17 
 
 
363 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  21.91 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>