More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5087 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5087  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 349 aa  686    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 351 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6293  FAD dependent oxidoreductase  81.44 
 
 		 107 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1786  FAD dependent oxidoreductase  81.44 
 
 		 107 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 390 aa  95.9  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7399  oxidoreductase  28.65 
 
 		 376 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  29.6 
 
 		 375 aa  91.3  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2536  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 364 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2618  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 403 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0576  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00335958  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  36.04 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  30.77 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0176  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 984 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 983 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5125  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78521  normal  0.0962359 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.58 
 
 		 503 aa  70.1  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 		 819 aa  70.1  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5548  oxidoreductase  27.52 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.84 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 799 aa  67.4  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 		 442 aa  67  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 441 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 		 394 aa  67  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 496 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  29.46 
 
 		 460 aa  66.2  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1385  D-amino-acid dehydrogenase  24.86 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.71736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 500 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 418 aa  65.9  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  29.01 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3994  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.96 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  28.65 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27740  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28.42 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1979  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 500 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  30.94 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  28.29 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  22.53 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 816 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 816 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.04 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  29.17 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 		 815 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  21.98 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  25.3 
 
 		 496 aa  60.1  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5421  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594548  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.41 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  26.25 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5880  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0408226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0313  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.71 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0687  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 462 aa  59.7  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.261465  normal  0.13641 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 401 aa  59.3  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  22.8 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  21.74 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  26.92 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  26.92 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  22.8 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  21.74 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  29.26 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  26.92 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 		 823 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  26.92 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  22.59 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 394 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0198  FAD dependent oxidoreductase  53.45 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.777626  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  22.47 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 437 aa  55.8  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  22.25 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  22.25 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0244  D-amino-acid dehydrogenase  26.01 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.227624 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 439 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>