9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6293 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6293  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
107 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1786  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
107 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5087  FAD dependent oxidoreductase  81.44 
 
 
349 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2618  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 
403 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7399  oxidoreductase  37.25 
 
 
376 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2536  FAD dependent oxidoreductase  43.14 
 
 
364 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2715  FAD dependent oxidoreductase  37.7 
 
 
424 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 
351 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  48.89 
 
 
390 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.445103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>