More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2618 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2618  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 403 aa  821    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 		 390 aa  169  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0176  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 373 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7399  oxidoreductase  27.3 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2536  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 364 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0576  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 365 aa  106  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00335958  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1979  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5880  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0408226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 382 aa  93.6  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5125  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 378 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78521  normal  0.0962359 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 		 383 aa  90.1  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5548  oxidoreductase  25.65 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1878  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  25.29 
 
 		 442 aa  87.4  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 		 423 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5421  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 378 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594548  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.95 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3533  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.972727  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 984 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  23.56 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 983 aa  78.2  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  25.68 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5087  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 430 aa  76.3  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  23.08 
 
 		 369 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.08 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  22.55 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  22.55 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.08 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  23.2 
 
 		 816 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27740  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  23.43 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  22.02 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  22.68 
 
 		 816 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  22.28 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 		 805 aa  72.4  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  27.86 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  22.55 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  22.02 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  22.02 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 		 960 aa  71.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  22.28 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  22.31 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  23.77 
 
 		 835 aa  70.5  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  23.9 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  23.02 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  28.21 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 393 aa  69.7  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2018  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0566522 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  24.3 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  23.5 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1503  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.19 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.839298  normal  0.265321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  21.9 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  23.2 
 
 		 879 aa  67.4  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  23.2 
 
 		 806 aa  67  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  25.62 
 
 		 379 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  23.55 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  23.55 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 823 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  21.68 
 
 		 815 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 799 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  27.6 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.1 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  24.59 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2715  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  23.37 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  21.18 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  22.68 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  22.68 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  22.68 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  27.8 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  23.64 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.87 
 
 		 838 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  22.54 
 
 		 815 aa  64.3  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>