173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2715 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2715  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 424 aa  828    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7399  oxidoreductase  33.58 
 
 		 376 aa  199  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2536  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 		 364 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0576  FAD dependent oxidoreductase  36.18 
 
 		 365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00335958  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1878  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 		 379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5880  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0408226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5125  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 378 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78521  normal  0.0962359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0176  FAD dependent oxidoreductase  34.41 
 
 		 373 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  32.99 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1979  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5548  oxidoreductase  27.3 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27740  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  30.9 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5421  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594548  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  28.5 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  26.73 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0423  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3080  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 816 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  26.34 
 
 		 819 aa  70.5  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  26.91 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2459  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 830 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2504  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 830 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2496  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 		 830 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 500 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2618  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 500 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 496 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.41 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  27.16 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1127  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46832  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  28.43 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3463  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.41 
 
 		 830 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  27.71 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  29.49 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2879  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.81 
 
 		 821 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  25.13 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.05 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.24 
 
 		 428 aa  57  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  28.61 
 
 		 372 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  26.14 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  24.05 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  26.6 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  25.74 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  23.9 
 
 		 369 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 401 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4207  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.81852  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  22.78 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  26.14 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5073  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  24.3 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  25.84 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  23.64 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  23.64 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  23.64 
 
 		 369 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  30.34 
 
 		 666 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.51 
 
 		 369 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 415 aa  53.5  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5994  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 374 aa  53.1  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57246  normal  0.360329 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07324  N,N-dimethylglycine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_2G16610)  25.82 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 960 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 439 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  29.79 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  27.08 
 
 		 1033 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2102  D-amino-acid dehydrogenase  28.16 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  25.19 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  34.41 
 
 		 377 aa  50.4  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 375 aa  50.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 		 374 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 		 374 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  25.57 
 
 		 420 aa  50.4  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  32.14 
 
 		 652 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 		 374 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 806 aa  50.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  22.08 
 
 		 369 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1981  D-amino-acid dehydrogenase  31.25 
 
 		 463 aa  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0772437 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 388 aa  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  24.01 
 
 		 389 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  29.66 
 
 		 666 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  22.91 
 
 		 380 aa  49.7  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 		 411 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.45 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  28.04 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.68 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  23.23 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>