More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2536 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2536  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 364 aa  717    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7399  oxidoreductase  35.58 
 
 		 376 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1878  FAD dependent oxidoreductase  35.98 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  36.54 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0576  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00335958  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2715  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5880  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0408226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5125  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 		 378 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78521  normal  0.0962359 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5548  oxidoreductase  31.28 
 
 		 373 aa  146  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5421  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 378 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594548  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1979  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 373 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0176  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 351 aa  109  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27740  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28.31 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2618  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 403 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  28.73 
 
 		 371 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  30.91 
 
 		 376 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  30.03 
 
 		 372 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  23.79 
 
 		 416 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  27.64 
 
 		 374 aa  87  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  27.22 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  31.83 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  28.53 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28.91 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 960 aa  81.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.1 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  31.27 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  26.22 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  25.75 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  26.47 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.63 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  27.03 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  27.03 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  25.95 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5087  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  27.03 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  25.95 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  31 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  27.03 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  25.95 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  26.42 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  25.95 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  26.42 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  23.75 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 983 aa  73.6  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  26.76 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 377 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  24.08 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.95 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.9 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  25.2 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 984 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  24.18 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  27.46 
 
 		 822 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  23.74 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  29.46 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  27.13 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  27.32 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  23.01 
 
 		 441 aa  67  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  22.56 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  25.14 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  29.37 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  23.31 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  27.88 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  25 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  28.9 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  29 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  25.3 
 
 		 420 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  25.97 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  27.27 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  27.65 
 
 		 401 aa  62.8  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0647  D-amino-acid dehydrogenase  29.6 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>