210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0176 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0176  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 373 aa  703    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5880  FAD dependent oxidoreductase  55.23 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0408226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5125  FAD dependent oxidoreductase  55.7 
 
 		 378 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78521  normal  0.0962359 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1979  FAD dependent oxidoreductase  54.01 
 
 		 373 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5421  FAD dependent oxidoreductase  55.28 
 
 		 378 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594548  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5548  oxidoreductase  49.6 
 
 		 373 aa  352  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27740  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  49.18 
 
 		 388 aa  305  7e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1878  FAD dependent oxidoreductase  36.63 
 
 		 379 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7399  oxidoreductase  29.97 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  34.05 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2715  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 424 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2536  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 		 364 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2618  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0576  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 		 365 aa  99.4  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00335958  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  29.89 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  34.42 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 382 aa  67  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  28.39 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  23.43 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3849  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121432  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 983 aa  63.5  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  28.21 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  22.8 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 960 aa  60.1  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 984 aa  59.7  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 		 812 aa  59.7  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 816 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0423  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  25.06 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  26.28 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 428 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  28.5 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 385 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3630  D-amino-acid dehydrogenase  24 
 
 		 417 aa  57  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258766 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06647  conserved hypothetical protein  29.39 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3856  sarcosine oxidase subunit beta  29.97 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.014492  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1275  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189046  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  21.84 
 
 		 365 aa  57  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  23.45 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  22.68 
 
 		 835 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  30.28 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4207  FAD dependent oxidoreductase  37.81 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.81852  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 446 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  30.23 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  27.47 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 816 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  30.08 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 		 799 aa  53.9  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 		 401 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  23.37 
 
 		 460 aa  53.9  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 451 aa  53.5  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 430 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28.3 
 
 		 389 aa  53.1  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  27.37 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 394 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 815 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.39 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 446 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  23.56 
 
 		 446 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  23.11 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.27 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  23.55 
 
 		 441 aa  50.4  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.9 
 
 		 418 aa  50.4  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18810  sarcosine oxidase, beta subunit family, heterotetrameric form  26.93 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  27.72 
 
 		 401 aa  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  29.47 
 
 		 379 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 375 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.02 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  24.11 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 496 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  22.79 
 
 		 837 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 500 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.02 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  31.46 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 447 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3171  phytoene dehydrogenase, putative  46.67 
 
 		 488 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>