More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1979 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1979  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 373 aa  754    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5125  FAD dependent oxidoreductase  54.01 
 
 		 378 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78521  normal  0.0962359 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27740  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  56.33 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5421  FAD dependent oxidoreductase  53.89 
 
 		 378 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594548  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5548  oxidoreductase  52.34 
 
 		 373 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5880  FAD dependent oxidoreductase  53.55 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0408226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0176  FAD dependent oxidoreductase  54.01 
 
 		 373 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1878  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 		 379 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7399  oxidoreductase  26.76 
 
 		 376 aa  116  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2715  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 424 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2536  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 390 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  29.04 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 351 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0576  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 365 aa  94  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00335958  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2618  FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 		 403 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  25.95 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 442 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  26.2 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  24.29 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  28.77 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  23.6 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 812 aa  63.9  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  23.18 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  27.27 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  22.64 
 
 		 446 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 		 799 aa  62.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  24.3 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 816 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  25.06 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  22.83 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 		 816 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  21.45 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.51 
 
 		 838 aa  59.7  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  24.47 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  22.25 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2597  D-amino-acid dehydrogenase  23.88 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  23.75 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  25.1 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.72 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  21.96 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  22.25 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.03 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 390 aa  57  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3113  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.26 
 
 		 436 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 385 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  23.73 
 
 		 445 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 496 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  21.58 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  24.47 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 500 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  21.95 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  26.56 
 
 		 418 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  22.4 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 500 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 492 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  24.03 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  24.74 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1545  D-amino-acid dehydrogenase  23.53 
 
 		 406 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  29.01 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  24.47 
 
 		 372 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  21.05 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 383 aa  53.5  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 442 aa  53.9  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  25.29 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 431 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  20.79 
 
 		 369 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  21.84 
 
 		 369 aa  53.1  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  22.25 
 
 		 443 aa  53.1  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1962  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 382 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 390 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 385 aa  53.1  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 414 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 442 aa  53.1  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  21.69 
 
 		 369 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  21.69 
 
 		 369 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 425 aa  52.8  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 592 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 427 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>