156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27740 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_27740  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  100 
 
 		 388 aa  773    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1979  FAD dependent oxidoreductase  56.33 
 
 		 373 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5548  oxidoreductase  45.9 
 
 		 373 aa  323  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5880  FAD dependent oxidoreductase  48.1 
 
 		 376 aa  318  7.999999999999999e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0408226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5125  FAD dependent oxidoreductase  44.24 
 
 		 378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78521  normal  0.0962359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0176  FAD dependent oxidoreductase  49.18 
 
 		 373 aa  305  7e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5421  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 		 378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594548  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1878  FAD dependent oxidoreductase  34.96 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7399  oxidoreductase  29.66 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2715  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 		 424 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2536  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 364 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 390 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 		 351 aa  97.1  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  31.42 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0576  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 365 aa  87  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00335958  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  25.4 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  22.65 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  23.54 
 
 		 390 aa  67  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2618  FAD dependent oxidoreductase  22.96 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  23.31 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  23.35 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  22.93 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  31 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  26.96 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  26.26 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 983 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 960 aa  60.5  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  28.85 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 984 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  25.12 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2572  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  24.17 
 
 		 383 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  22.99 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 367 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  22.19 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 		 375 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 394 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  25.84 
 
 		 394 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2431  D-amino-acid dehydrogenase  24.53 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  25 
 
 		 375 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 390 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0647  D-amino-acid dehydrogenase  27.24 
 
 		 452 aa  53.5  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  27.38 
 
 		 822 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2516  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  27.31 
 
 		 572 aa  53.1  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.191896 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3849  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121432  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 445 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  23.6 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3020  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.393882  normal  0.050284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 		 375 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 		 375 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2122  D-amino-acid dehydrogenase  28.12 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17481  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 401 aa  50.4  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6079  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.88 
 
 		 421 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.84 
 
 		 389 aa  50.4  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 378 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.98 
 
 		 838 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0198  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 		 408 aa  49.7  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.777626  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  22.57 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  28.46 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  28.46 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  24.12 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  25.91 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3505  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 465 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5087  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 349 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0369  D-amino-acid dehydrogenase  28.34 
 
 		 421 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  28.74 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 375 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>