More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3020 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3020  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
367 aa  720    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.393882  normal  0.050284 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2625  FAD dependent oxidoreductase  49.58 
 
 
393 aa  289  4e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0620146  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1292  FAD dependent oxidoreductase  47.73 
 
 
395 aa  250  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0636  FAD dependent oxidoreductase  42.09 
 
 
433 aa  230  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.188486  normal  0.91294 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 
373 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 
392 aa  119  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3849  FAD dependent oxidoreductase  33.78 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121432  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 
383 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 
382 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 
381 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 
382 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
385 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
387 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 
496 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 
385 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 
395 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 
399 aa  103  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  30.11 
 
 
386 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 
500 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 
500 aa  99.4  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 
385 aa  99.4  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 
376 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
492 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
388 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 
401 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 
387 aa  92.8  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3845  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 
385 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 
398 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 
398 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 
398 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 
819 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 
391 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  25.13 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 
831 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 
816 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 
816 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.39 
 
 
838 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 
398 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
806 aa  77.4  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  24.87 
 
 
831 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 
816 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
817 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  21.22 
 
 
372 aa  73.2  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 
378 aa  73.2  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 
387 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 
388 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 
815 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 
823 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2117  sarcosine oxidase subunit beta  24.52 
 
 
417 aa  72  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 
799 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  24.85 
 
 
805 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 
806 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0591  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.14 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18810  sarcosine oxidase, beta subunit family, heterotetrameric form  24.58 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  26.8 
 
 
822 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3736  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.46 
 
 
417 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.42969  normal  0.377029 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
375 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 
827 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3868  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 
402 aa  69.3  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0943449  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0497  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.317622  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3991  sarcosine oxidase, beta subunit family  23.01 
 
 
417 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  23.34 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  27.7 
 
 
375 aa  67  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 
815 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  22.61 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8584  sarcosine oxidase, beta subunit family  24.66 
 
 
417 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738598  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4031  sarcosine oxidase, beta subunit family  22.91 
 
 
417 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0301  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.98 
 
 
417 aa  66.2  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 
428 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  22.76 
 
 
427 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2487  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.46 
 
 
417 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 
827 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 
426 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  21.87 
 
 
372 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>