More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3868 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013923  Nmag_3868  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 402 aa  804    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0943449  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3849  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121432  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3845  FAD dependent oxidoreductase  32.98 
 
 		 381 aa  167  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 376 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  29.8 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 392 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  23.84 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  23.54 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 496 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 		 500 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 825 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 500 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 823 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3020  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 367 aa  66.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.393882  normal  0.050284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 819 aa  65.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.87 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  29.02 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 		 815 aa  63.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 816 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 799 aa  64.3  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.42 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1141  sarcosine oxidase beta subunit family protein  25.45 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  29.63 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 815 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3533  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.972727  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 		 816 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2266  putative sarcosine oxidase, beta subunit  23.91 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.547041 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  26.12 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  26.64 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  26.12 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  26.12 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  26.12 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.96 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  30.77 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  27.03 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  30.32 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  26.21 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2459  Methylated-DNA--(protein)-cysteine S-methyltransferase  23.71 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000162707  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  30.77 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  28.81 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28.93 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1654  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.24 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  26.1 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1676  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.71 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000458622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1334  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.71 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195044  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  24.09 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1960  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.71 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00842903  normal  0.752905 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2436  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.71 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0019507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  30.77 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1292  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.71 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000190637  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01174  hypothetical protein  23.71 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1347  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.71 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.15982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  28.81 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>