More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0636 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0636  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 433 aa  832    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.188486  normal  0.91294 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2625  FAD dependent oxidoreductase  46.88 
 
 		 393 aa  269  8e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0620146  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3020  FAD dependent oxidoreductase  41.58 
 
 		 367 aa  241  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.393882  normal  0.050284 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1292  FAD dependent oxidoreductase  44.39 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3849  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 392 aa  96.7  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.24 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 388 aa  94.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 401 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  23.77 
 
 		 381 aa  90.5  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  23.42 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 		 385 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3845  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  21.9 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  22.57 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  22.7 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  21.05 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 365 aa  76.3  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  25.69 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 465 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  23.29 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3155  hypothetical protein  27.23 
 
 		 831 aa  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  23.32 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 837 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  26.7 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 500 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2516  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  28.05 
 
 		 572 aa  60.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.191896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  23.74 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  24.94 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 500 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0933  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  29.02 
 
 		 556 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0218972  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  26.7 
 
 		 831 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 806 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  24.31 
 
 		 805 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  27.49 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3249  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 831 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0784832  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4780  D-amino-acid dehydrogenase  26.52 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  24.57 
 
 		 455 aa  57  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  25.3 
 
 		 425 aa  57  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  25.57 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 394 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 		 376 aa  53.9  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  26.99 
 
 		 378 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1996  fused 5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme methyltransferase and FAD-dependent demodification enzyme  25.19 
 
 		 690 aa  53.9  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.155036  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  25.59 
 
 		 378 aa  54.3  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  22.25 
 
 		 427 aa  53.9  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 431 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 492 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1275  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 482 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189046  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  36.14 
 
 		 1033 aa  53.9  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  24.12 
 
 		 384 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1527  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 		 416 aa  53.5  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1471  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  27.08 
 
 		 585 aa  53.5  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 		 835 aa  53.1  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>