195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5421 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5125  FAD dependent oxidoreductase  86.51 
 
 		 378 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78521  normal  0.0962359 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5421  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 378 aa  754    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594548  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5548  oxidoreductase  66.58 
 
 		 373 aa  490  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5880  FAD dependent oxidoreductase  63.07 
 
 		 376 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0408226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1979  FAD dependent oxidoreductase  53.89 
 
 		 373 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0176  FAD dependent oxidoreductase  55.28 
 
 		 373 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27740  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  44.47 
 
 		 388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1878  FAD dependent oxidoreductase  34.77 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7399  oxidoreductase  30.59 
 
 		 376 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2536  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 364 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2715  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 424 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 351 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0576  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 365 aa  96.7  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00335958  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 816 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 816 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  27.18 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2618  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  26.34 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  25.51 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  23.73 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  23.73 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  24.8 
 
 		 369 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  24.8 
 
 		 369 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  23.47 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  23.47 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.45 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.87 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.54 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  23.47 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.47 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 526 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  23.16 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  22.47 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1989  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00570868  normal  0.118525 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  26.22 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  26.07 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  22.47 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2181  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2431  D-amino-acid dehydrogenase  26.38 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1962  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  28.7 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  23.35 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 823 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  25.63 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  26.43 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  24.44 
 
 		 441 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 799 aa  55.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4780  D-amino-acid dehydrogenase  25.29 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  27.65 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 375 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 		 369 aa  53.9  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  22.69 
 
 		 365 aa  53.9  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  24.47 
 
 		 378 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  21.48 
 
 		 460 aa  53.9  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 447 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  26.41 
 
 		 447 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  23.19 
 
 		 428 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.35 
 
 		 420 aa  53.1  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  27.15 
 
 		 367 aa  53.1  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  21.73 
 
 		 418 aa  53.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  22.22 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06647  conserved hypothetical protein  27.65 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  23.23 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 812 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 431 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 		 472 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 442 aa  50.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 385 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 385 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 441 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 		 383 aa  50.1  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 374 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0827  D-amino-acid dehydrogenase  29.96 
 
 		 419 aa  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.365024  normal  0.0750347 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  22.81 
 
 		 442 aa  50.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  22.71 
 
 		 817 aa  49.7  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  22.87 
 
 		 430 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  23.27 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  23.58 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2018  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0566522 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>