More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1878 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1878  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 379 aa  740    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7399  oxidoreductase  35.42 
 
 		 376 aa  228  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5880  FAD dependent oxidoreductase  36.46 
 
 		 376 aa  206  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0408226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2536  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 		 364 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5125  FAD dependent oxidoreductase  34.77 
 
 		 378 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78521  normal  0.0962359 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5421  FAD dependent oxidoreductase  34.77 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594548  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27740  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  34.96 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1979  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5548  oxidoreductase  32.71 
 
 		 373 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0176  FAD dependent oxidoreductase  36.63 
 
 		 373 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0576  FAD dependent oxidoreductase  35.54 
 
 		 365 aa  170  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00335958  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2715  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 424 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  35.41 
 
 		 390 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  30.08 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.69 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 385 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2618  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1127  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  25.65 
 
 		 368 aa  87  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2572  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 407 aa  87  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  29.85 
 
 		 376 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 960 aa  84.3  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 		 816 aa  82.8  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  29.23 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 		 816 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  28.57 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  28.19 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  28.53 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 375 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0423  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  28.04 
 
 		 371 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  25.23 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  23.54 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  23.3 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  23.27 
 
 		 823 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  26.77 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 496 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  26.22 
 
 		 1033 aa  69.3  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  28.12 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 500 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  24.27 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  24.53 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  27.95 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  29.59 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  29.59 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  27.82 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2962  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  24.61 
 
 		 556 aa  66.6  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  24.45 
 
 		 835 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  25.39 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 492 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 		 835 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 815 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 		 984 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  27.2 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  23.14 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 983 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1177  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.624502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  26.45 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 825 aa  63.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  25.65 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  29.05 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3499  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 522 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  23.43 
 
 		 817 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  34.91 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  27.55 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 819 aa  62.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0704  hypothetical protein  29.13 
 
 		 699 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>