27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0423 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0423  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 332 aa  622  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0576  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00335958  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7399  oxidoreductase  26.03 
 
 		 376 aa  67  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2715  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0176  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1878  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2536  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 364 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  22.89 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2618  FAD dependent oxidoreductase  41.38 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  24.79 
 
 		 365 aa  46.6  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  30.98 
 
 		 372 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27740  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.11 
 
 		 388 aa  46.2  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5125  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78521  normal  0.0962359 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5548  oxidoreductase  22.54 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  40.3 
 
 		 416 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1979  FAD dependent oxidoreductase  38.24 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  28.81 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  33.13 
 
 		 390 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5880  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 376 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0408226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1671  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  55.81 
 
 		 654 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19400  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  55.81 
 
 		 654 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4229  D-amino-acid dehydrogenase  27.5 
 
 		 415 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.825619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5421  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 378 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594548  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5234  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  44.23 
 
 		 558 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.542472  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  31.72 
 
 		 375 aa  42.7  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 375 aa  42.7  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  36.73 
 
 		 414 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>