More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1828 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 371 aa  728    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  46.7 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  47.95 
 
 		 371 aa  346  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  47.95 
 
 		 371 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  47.95 
 
 		 371 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  47.95 
 
 		 371 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  47.4 
 
 		 371 aa  342  8e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  47.4 
 
 		 371 aa  341  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  47.67 
 
 		 371 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  47.4 
 
 		 371 aa  339  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  47.12 
 
 		 371 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  47.12 
 
 		 371 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  48.75 
 
 		 374 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  48.89 
 
 		 375 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  43.29 
 
 		 371 aa  266  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0188  FAD dependent oxidoreductase  46.05 
 
 		 380 aa  219  8.999999999999998e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.887396  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  36.09 
 
 		 377 aa  212  7e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1201  iminodiacetate oxidase, putative  31.15 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2101  FAD dependent oxidoreductase  38.02 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1225  oxidoreductase, DadA family protein/D-amino acid oxidase  31.62 
 
 		 363 aa  176  7e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  34.24 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2067  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  27.81 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  30.19 
 
 		 374 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.65 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  27.69 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  28.83 
 
 		 1033 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  30.67 
 
 		 392 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  30.98 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  27.08 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3277  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 367 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  29.62 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  28.09 
 
 		 405 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  25.82 
 
 		 367 aa  92.8  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  30.6 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.47 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  28.98 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3051  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0899897 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  30 
 
 		 375 aa  89.7  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 378 aa  89.4  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  26.36 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  23.42 
 
 		 372 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  27.97 
 
 		 361 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  28.41 
 
 		 440 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.6 
 
 		 432 aa  86.3  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 394 aa  86.3  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  27.75 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  25.79 
 
 		 666 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  23.35 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  23.27 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  22.99 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  29.28 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  23.33 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.27 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  23.33 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.91 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0235  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.29 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.65 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.76 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  29.39 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  28.01 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.91 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  23.95 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.91 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  24.16 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  23.69 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  23.69 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.88 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  22.35 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  25.5 
 
 		 666 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  23.64 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.42 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.87 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  31.25 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  28.09 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.42 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  27.15 
 
 		 404 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  23.42 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  29 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  31.25 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0101  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  24.94 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  28.62 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47980  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.99 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  26.37 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  27.9 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  22.61 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.7 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  22.06 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  24.64 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.53 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  29.23 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  27.91 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>