More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3977 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
377 aa  751    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  40.91 
 
 
373 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  39.72 
 
 
374 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 
375 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  38.24 
 
 
371 aa  252  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  38.24 
 
 
371 aa  252  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  38.24 
 
 
371 aa  252  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  38.35 
 
 
371 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  38.35 
 
 
371 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  38.07 
 
 
371 aa  250  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  38.35 
 
 
371 aa  249  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.68 
 
 
371 aa  249  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  37.78 
 
 
371 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  37.68 
 
 
371 aa  247  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  41.76 
 
 
371 aa  228  9e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 
371 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0188  FAD dependent oxidoreductase  41.64 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.887396  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 
375 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  33.51 
 
 
374 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2101  FAD dependent oxidoreductase  34.56 
 
 
372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  34.73 
 
 
392 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1201  iminodiacetate oxidase, putative  28.12 
 
 
367 aa  144  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  31.98 
 
 
375 aa  143  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1225  oxidoreductase, DadA family protein/D-amino acid oxidase  30.73 
 
 
363 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  31.58 
 
 
372 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  33.62 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  26.76 
 
 
372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  33.86 
 
 
405 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  31.69 
 
 
391 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  26.74 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  31.23 
 
 
372 aa  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  28.72 
 
 
382 aa  125  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  32.14 
 
 
361 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  32.47 
 
 
364 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  31.05 
 
 
365 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  32.49 
 
 
404 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  27.5 
 
 
369 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  28.07 
 
 
652 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  28.01 
 
 
369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  29.09 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  27.57 
 
 
369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  31.4 
 
 
401 aa  116  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  27.65 
 
 
369 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  31.37 
 
 
404 aa  116  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  31.82 
 
 
376 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  27.3 
 
 
369 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  29.3 
 
 
388 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3277  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 
367 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
367 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 
366 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3051  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
366 aa  113  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0899897 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  25.07 
 
 
369 aa  112  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  28.57 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  27.03 
 
 
1033 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  26.7 
 
 
369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  26.7 
 
 
369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  28.89 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  26.7 
 
 
369 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  26.7 
 
 
369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  30.75 
 
 
367 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  26.18 
 
 
369 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  27.45 
 
 
360 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  30.35 
 
 
363 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 
365 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
363 aa  106  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  27.92 
 
 
363 aa  106  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  27.81 
 
 
375 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  31.71 
 
 
440 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
382 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
365 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  27.12 
 
 
375 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 
365 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  28.69 
 
 
373 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  26.97 
 
 
666 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 
360 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 
390 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  29.49 
 
 
371 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  31.11 
 
 
411 aa  103  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  27.3 
 
 
385 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  37.06 
 
 
377 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 
378 aa  102  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  27.18 
 
 
417 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  27.27 
 
 
417 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2067  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  23.55 
 
 
370 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  29.92 
 
 
361 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  26.69 
 
 
666 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  27.42 
 
 
365 aa  100  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  28.81 
 
 
395 aa  99.8  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  26.56 
 
 
368 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  29.26 
 
 
368 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  30.16 
 
 
375 aa  99.8  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  28.46 
 
 
349 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
375 aa  97.1  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  24.93 
 
 
652 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.84 
 
 
369 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 
361 aa  95.5  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.9 
 
 
369 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>