More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1385 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1385  D-amino-acid dehydrogenase  100 
 
 		 401 aa  825    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.71736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1999  D-amino-acid dehydrogenase  45.41 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0700  D-amino acid dehydrogenase small subunit  41.61 
 
 		 425 aa  312  6.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1545  D-amino-acid dehydrogenase  46.52 
 
 		 406 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4708  D-amino-acid dehydrogenase  41.65 
 
 		 416 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2074  D-amino acid dehydrogenase small subunit  42.75 
 
 		 422 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00739126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4738  D-amino-acid dehydrogenase  45.54 
 
 		 408 aa  299  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0069  D-amino-acid dehydrogenase  44.11 
 
 		 411 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4441  D-amino acid dehydrogenase 2 small subunit  41.9 
 
 		 417 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136724  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0215  putative D-amino acid dehydrogenase 2, small subunit  41.79 
 
 		 415 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0948  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  41.9 
 
 		 415 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1933  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  41.9 
 
 		 415 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1670  hypothetical protein  41.9 
 
 		 415 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2211  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  41.9 
 
 		 415 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0305  putative D-amino acid dehydrogenase 2, small subunit  41.9 
 
 		 415 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1236  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  41.9 
 
 		 415 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2001  D-amino-acid dehydrogenase  40.3 
 
 		 416 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2467  D-amino acid dehydrogenase small subunit  41.77 
 
 		 422 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4229  D-amino-acid dehydrogenase  39.15 
 
 		 415 aa  285  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.825619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3716  D-amino-acid dehydrogenase  39.53 
 
 		 429 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276162 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0223  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  40.94 
 
 		 445 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2262  D-amino acid dehydrogenase small subunit  43.42 
 
 		 425 aa  276  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.66021  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2380  D-amino-acid dehydrogenase  36.63 
 
 		 428 aa  276  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0751  D-amino-acid dehydrogenase  36.67 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2589  D-amino acid dehydrogenase small subunit  40.3 
 
 		 426 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3159  D-amino-acid dehydrogenase  36.19 
 
 		 436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0528  D-amino-acid dehydrogenase  36.08 
 
 		 443 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0091768  hitchhiker  0.00000110387 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3886  D-amino-acid dehydrogenase  36.19 
 
 		 436 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.694538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4507  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.42 
 
 		 439 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1936  D-amino-acid dehydrogenase  41.46 
 
 		 429 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67150  putative oxidoreductase  40.5 
 
 		 416 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5823  putative oxidoreductase  39.21 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.5 
 
 		 416 aa  252  9.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5290  D-amino-acid dehydrogenase  38.33 
 
 		 413 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.23 
 
 		 416 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1408  D-amino-acid dehydrogenase  38.42 
 
 		 422 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2093  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.31 
 
 		 416 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59754  normal  0.0350619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2864  D-amino-acid dehydrogenase  34.16 
 
 		 417 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.30815  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3520  D-amino-acid dehydrogenase  36.59 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.553559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.01 
 
 		 416 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0866  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.5 
 
 		 416 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6079  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.17 
 
 		 421 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.25 
 
 		 416 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1503  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.92 
 
 		 425 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.839298  normal  0.265321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  34.07 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.69 
 
 		 418 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.25 
 
 		 433 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.5 
 
 		 416 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.06 
 
 		 418 aa  239  8e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0558  D-amino-acid dehydrogenase small subunit  34.16 
 
 		 419 aa  239  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  34.81 
 
 		 419 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0673  D-amino-acid dehydrogenase  33.25 
 
 		 417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180164  hitchhiker  0.00553067 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0313  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.84 
 
 		 421 aa  235  9e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47980  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.29 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.83 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3877  D-amino-acid dehydrogenase  39.27 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1546  FAD dependent oxidoreductase  36.12 
 
 		 419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3394  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 		 414 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.361362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4473  D-amino-acid dehydrogenase  35 
 
 		 417 aa  233  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0948  D-amino-acid dehydrogenase  34.39 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0131  D-amino-acid dehydrogenase  32.61 
 
 		 444 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.814059  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3630  D-amino-acid dehydrogenase  31.68 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258766 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2449  D-amino-acid dehydrogenase  35.44 
 
 		 404 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.504672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2000  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.83 
 
 		 435 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.881788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.84 
 
 		 432 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.29 
 
 		 436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5009  D-amino-acid dehydrogenase  31.43 
 
 		 448 aa  226  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3113  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.29 
 
 		 436 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.59 
 
 		 432 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0148  D-amino-acid dehydrogenase  32.86 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.739629  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  33.17 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.67 
 
 		 432 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0090  D-amino-acid dehydrogenase  31.43 
 
 		 446 aa  223  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1556  D-amino-acid dehydrogenase  39.01 
 
 		 397 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.55 
 
 		 419 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0071  D-amino-acid dehydrogenase  31.43 
 
 		 454 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6239  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 414 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1023  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.75 
 
 		 428 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6641  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 414 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6408  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 414 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.16 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.58 
 
 		 433 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.5 
 
 		 434 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4178  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.5 
 
 		 428 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33 
 
 		 428 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2082  D-amino-acid dehydrogenase  31.25 
 
 		 418 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.5 
 
 		 433 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0122  D-amino-acid dehydrogenase  35.89 
 
 		 407 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.33 
 
 		 435 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.385338  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0585  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.75 
 
 		 428 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1064  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.75 
 
 		 428 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4311  D-amino-acid dehydrogenase  39.01 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.67 
 
 		 432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.25 
 
 		 434 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0886  FAD dependent oxidoreductase  36.01 
 
 		 439 aa  219  7.999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.25 
 
 		 434 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.25 
 
 		 428 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1094  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 		 421 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.25 
 
 		 434 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>