82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3583 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 609 aa  1241    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  42.73 
 
 		 989 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  38.85 
 
 		 594 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  38.85 
 
 		 594 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  38.85 
 
 		 594 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  41.94 
 
 		 565 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2348  hypothetical protein  27.15 
 
 		 972 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284959 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2356  hypothetical protein  27.15 
 
 		 972 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2309  hypothetical protein  27.15 
 
 		 972 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2308  FAD dependent oxidoreductase  22.82 
 
 		 570 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231532  normal  0.0778846 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2030  FAD dependent oxidoreductase  23.71 
 
 		 577 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2295  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 		 578 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13759  oxidoreductase  25.92 
 
 		 602 aa  89  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649685  normal  0.108342 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  23.85 
 
 		 488 aa  67.4  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.16 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  25.73 
 
 		 459 aa  63.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.87 
 
 		 459 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  22.61 
 
 		 591 aa  61.2  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  23.03 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  24.2 
 
 		 453 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  22.59 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  22.22 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  21.83 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  21.83 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.19 
 
 		 640 aa  58.2  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  24.05 
 
 		 455 aa  56.6  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  29.03 
 
 		 647 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  29.03 
 
 		 647 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  24.41 
 
 		 639 aa  56.2  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  23.34 
 
 		 460 aa  55.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  22.86 
 
 		 478 aa  53.9  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  23.27 
 
 		 463 aa  53.9  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  34.19 
 
 		 647 aa  53.9  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  22.74 
 
 		 453 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  21.25 
 
 		 479 aa  53.5  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  21.87 
 
 		 482 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.57 
 
 		 643 aa  52.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  21.63 
 
 		 483 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  24.18 
 
 		 438 aa  51.6  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  21.76 
 
 		 499 aa  50.8  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  24.15 
 
 		 489 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  40.79 
 
 		 645 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  21.54 
 
 		 479 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  22.4 
 
 		 461 aa  49.3  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  53.19 
 
 		 572 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  30 
 
 		 460 aa  49.3  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  21.97 
 
 		 453 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  42.16 
 
 		 495 aa  48.5  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  30 
 
 		 462 aa  48.5  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  21.14 
 
 		 453 aa  48.5  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  22.26 
 
 		 484 aa  47.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.23 
 
 		 639 aa  47.4  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  50 
 
 		 580 aa  47  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  48.08 
 
 		 560 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  23.9 
 
 		 462 aa  47  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 425 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  51.02 
 
 		 449 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  39.13 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.57 
 
 		 433 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06887  protoporphyrinogen  51.22 
 
 		 129 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2156  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  28.15 
 
 		 667 aa  46.2  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  23.2 
 
 		 552 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  46.94 
 
 		 560 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  46.94 
 
 		 560 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  35.8 
 
 		 644 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  39.08 
 
 		 565 aa  45.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4607  FAD dependent oxidoreductase  61.76 
 
 		 364 aa  45.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  22.24 
 
 		 486 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  35.71 
 
 		 544 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  21.78 
 
 		 484 aa  44.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  44.9 
 
 		 560 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  51.92 
 
 		 425 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 		 769 aa  44.3  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  39.68 
 
 		 523 aa  44.3  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  24.1 
 
 		 624 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  35.71 
 
 		 559 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  22.63 
 
 		 506 aa  44.3  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  22.63 
 
 		 506 aa  44.3  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  48.89 
 
 		 560 aa  44.3  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.44 
 
 		 642 aa  44.3  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0082  hypothetical protein  31.52 
 
 		 769 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00502388  hitchhiker  0.00904 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  22.74 
 
 		 486 aa  43.9  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>