85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1432 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  60.8 
 
 		 570 aa  701    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  60.64 
 
 		 560 aa  729    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  60.82 
 
 		 560 aa  728    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  100 
 
 		 580 aa  1173    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  61 
 
 		 560 aa  731    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  60.82 
 
 		 560 aa  730    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  67.76 
 
 		 578 aa  793    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  68.66 
 
 		 576 aa  784    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  62.34 
 
 		 572 aa  684    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  62.41 
 
 		 566 aa  692    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  60.71 
 
 		 560 aa  731    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  57.44 
 
 		 565 aa  635    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  60.29 
 
 		 559 aa  724    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  60.36 
 
 		 544 aa  712    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  59.13 
 
 		 556 aa  629  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  38.09 
 
 		 623 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4304  tryptophan 2-monooxygenase  34.29 
 
 		 649 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0401456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  30.81 
 
 		 563 aa  207  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  30.65 
 
 		 557 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  29.37 
 
 		 575 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  29.44 
 
 		 562 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  28.7 
 
 		 723 aa  186  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  25.29 
 
 		 482 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  24.31 
 
 		 478 aa  109  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  24.85 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  21.8 
 
 		 564 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  23.84 
 
 		 478 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  23.84 
 
 		 478 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  24.45 
 
 		 487 aa  103  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  24.45 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  24.3 
 
 		 490 aa  102  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  24.25 
 
 		 482 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  24.25 
 
 		 482 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  24.25 
 
 		 487 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  24.05 
 
 		 482 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  24.46 
 
 		 490 aa  100  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  24.3 
 
 		 490 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  24.19 
 
 		 491 aa  97.4  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  23.95 
 
 		 478 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  23.43 
 
 		 478 aa  96.3  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  26.15 
 
 		 492 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  23.29 
 
 		 478 aa  94  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  23.29 
 
 		 478 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  23.58 
 
 		 644 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  29.44 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5898  amine oxidase  23.89 
 
 		 803 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  29.44 
 
 		 478 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  23.57 
 
 		 572 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  21.42 
 
 		 573 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  34.88 
 
 		 523 aa  72.8  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  48.68 
 
 		 503 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  27.98 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  28.23 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  29.02 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  25.26 
 
 		 541 aa  57.8  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  21.52 
 
 		 526 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  24.62 
 
 		 624 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  24.56 
 
 		 531 aa  54.3  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  21.74 
 
 		 535 aa  52.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  22.76 
 
 		 533 aa  52  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  22.2 
 
 		 533 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  32.48 
 
 		 355 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  37.35 
 
 		 332 aa  50.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  40.48 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4256  hypothetical protein  31.96 
 
 		 157 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  24.33 
 
 		 628 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1491  hypothetical protein  29.55 
 
 		 587 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.287152  normal  0.0494428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  41.18 
 
 		 594 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  41.18 
 
 		 594 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  41.18 
 
 		 594 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  30 
 
 		 524 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  35.8 
 
 		 456 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  28.73 
 
 		 421 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 609 aa  47  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  30.3 
 
 		 519 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  22.73 
 
 		 427 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  45.24 
 
 		 382 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  34.15 
 
 		 457 aa  45.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2502  amine oxidase  43.33 
 
 		 557 aa  44.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  23.96 
 
 		 537 aa  44.7  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  29.27 
 
 		 530 aa  43.9  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  30.93 
 
 		 532 aa  43.9  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  37.5 
 
 		 343 aa  43.9  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87428  glutamate synthase  46.15 
 
 		 2126 aa  43.9  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  43.9 
 
 		 444 aa  43.9  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>