118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0407 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  99.82 
 
 		 560 aa  1159    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  56.96 
 
 		 570 aa  686    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  88.24 
 
 		 544 aa  1019    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  87.99 
 
 		 559 aa  1043    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  90.54 
 
 		 560 aa  1063    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  61.76 
 
 		 576 aa  736    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  68.05 
 
 		 556 aa  744    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  100 
 
 		 560 aa  1162    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  57.38 
 
 		 566 aa  673    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  60.82 
 
 		 580 aa  730    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  55.1 
 
 		 565 aa  639    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  96.61 
 
 		 560 aa  1135    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  95.54 
 
 		 560 aa  1126    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  61.12 
 
 		 578 aa  736    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  57.48 
 
 		 572 aa  663    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  35.32 
 
 		 623 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4304  tryptophan 2-monooxygenase  32.96 
 
 		 649 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0401456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  30.42 
 
 		 563 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  30.18 
 
 		 557 aa  203  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  29.44 
 
 		 575 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  28.18 
 
 		 723 aa  192  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  28.07 
 
 		 562 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  26.59 
 
 		 492 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  24.02 
 
 		 523 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  23.59 
 
 		 564 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  26.22 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  25.65 
 
 		 478 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  22.87 
 
 		 644 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  23.9 
 
 		 487 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5898  amine oxidase  24.59 
 
 		 803 aa  90.5  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  23.65 
 
 		 485 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  22.73 
 
 		 572 aa  87  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  23.15 
 
 		 490 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  23.72 
 
 		 482 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  23.72 
 
 		 482 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  23.15 
 
 		 491 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  23.72 
 
 		 487 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  23.52 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  23.25 
 
 		 490 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  23.39 
 
 		 487 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  22.55 
 
 		 490 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  22.89 
 
 		 541 aa  78.6  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  22.56 
 
 		 527 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  23.25 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  22.73 
 
 		 516 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  23.03 
 
 		 533 aa  67.8  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  22.51 
 
 		 533 aa  65.9  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  43.82 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  22.33 
 
 		 530 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  22.29 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  25.82 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  35.48 
 
 		 573 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  24.47 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  26.7 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  23.94 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  24.59 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  24.59 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  24.47 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  24.47 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  23.28 
 
 		 526 aa  57  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  23.4 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  23.4 
 
 		 478 aa  55.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  23.94 
 
 		 478 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  20.57 
 
 		 535 aa  54.3  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  25.5 
 
 		 516 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  23.97 
 
 		 531 aa  53.9  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  22.08 
 
 		 507 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  36.11 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  23.53 
 
 		 624 aa  50.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  36.07 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4256  hypothetical protein  31.91 
 
 		 157 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  40.54 
 
 		 698 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  41.38 
 
 		 594 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  42.5 
 
 		 456 aa  48.5  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  41.38 
 
 		 594 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  34.57 
 
 		 456 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  41.38 
 
 		 594 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  22.79 
 
 		 465 aa  48.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  36.59 
 
 		 457 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  22.2 
 
 		 528 aa  47.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  46.77 
 
 		 480 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02350  L-amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5UL69]  31.25 
 
 		 685 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  36.71 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  46.94 
 
 		 609 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  38.46 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  30.1 
 
 		 519 aa  46.2  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20342  synthase of glutamate synthase  43.24 
 
 		 580 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11010  glutamate synthase (NADH) small subunit  47.46 
 
 		 486 aa  46.2  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.709567  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  31.19 
 
 		 350 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  30.46 
 
 		 469 aa  45.1  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  36.26 
 
 		 492 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  22.65 
 
 		 418 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  40.51 
 
 		 427 aa  45.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  39.24 
 
 		 447 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  37.97 
 
 		 428 aa  45.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  23.53 
 
 		 492 aa  45.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  46.81 
 
 		 421 aa  45.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  34.62 
 
 		 479 aa  44.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  57.5 
 
 		 644 aa  44.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  35.65 
 
 		 493 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>