272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2005 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  100 
 
 		 492 aa  989    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  41.58 
 
 		 499 aa  296  7e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  41.38 
 
 		 465 aa  295  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  40.48 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  39.47 
 
 		 450 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  39.47 
 
 		 450 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  38.84 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  36.59 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  35.46 
 
 		 454 aa  244  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  38.88 
 
 		 439 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  36.2 
 
 		 456 aa  242  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  37.83 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  37.47 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  35.19 
 
 		 459 aa  233  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  36.42 
 
 		 492 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  36.68 
 
 		 452 aa  229  7e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  34.2 
 
 		 484 aa  228  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  36.09 
 
 		 493 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  36.34 
 
 		 578 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  33.47 
 
 		 494 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  35.28 
 
 		 493 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 		 494 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  35.28 
 
 		 493 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  36.54 
 
 		 494 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  34.27 
 
 		 490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  35.11 
 
 		 532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  33.04 
 
 		 457 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  34.5 
 
 		 493 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  32.59 
 
 		 487 aa  209  8e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  33.62 
 
 		 456 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  32.6 
 
 		 498 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  32.6 
 
 		 498 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  32.75 
 
 		 498 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  31.6 
 
 		 462 aa  190  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  31.81 
 
 		 463 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  32.31 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  33.63 
 
 		 458 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  32.59 
 
 		 445 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  26.36 
 
 		 510 aa  171  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  31.56 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  29.06 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  27.25 
 
 		 469 aa  160  3e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  28.36 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  27.78 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  26.51 
 
 		 457 aa  136  8e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  28.13 
 
 		 438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  24.34 
 
 		 459 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  30.28 
 
 		 510 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  26.12 
 
 		 496 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  27.88 
 
 		 495 aa  98.2  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  25 
 
 		 479 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  26.07 
 
 		 496 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  25.3 
 
 		 496 aa  96.7  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  25.55 
 
 		 435 aa  94.4  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  24.47 
 
 		 478 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  24.47 
 
 		 478 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  21.32 
 
 		 436 aa  90.1  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  24.58 
 
 		 482 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  24.58 
 
 		 482 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  24.58 
 
 		 482 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  24.58 
 
 		 487 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  30.61 
 
 		 352 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  23.85 
 
 		 490 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  29.13 
 
 		 466 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  24.37 
 
 		 485 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  24.16 
 
 		 490 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  23.64 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  26.41 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  28.07 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  24 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  25.6 
 
 		 625 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  23.64 
 
 		 487 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  23.4 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  24.22 
 
 		 495 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  25.11 
 
 		 592 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  23.52 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  29.51 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  25.05 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  27.16 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  25.7 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  22.76 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  25.16 
 
 		 495 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  23.94 
 
 		 565 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  23.66 
 
 		 527 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  25.54 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  23.98 
 
 		 619 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  25.26 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  25.11 
 
 		 624 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  23.34 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  23.58 
 
 		 619 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  29.27 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  23.37 
 
 		 616 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  27.6 
 
 		 365 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  22.94 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  27.24 
 
 		 543 aa  70.1  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  28.8 
 
 		 367 aa  69.7  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  24.17 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4453  amine oxidase  26.24 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  24.84 
 
 		 419 aa  67  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  24.27 
 
 		 466 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>