More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2472 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  100 
 
 		 459 aa  926    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  45.12 
 
 		 447 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  46.22 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  46.22 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  46.38 
 
 		 446 aa  358  9e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  44.25 
 
 		 454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  45.5 
 
 		 439 aa  342  7e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  36.38 
 
 		 465 aa  263  6.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  36.67 
 
 		 492 aa  256  7e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  34.08 
 
 		 459 aa  246  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  33.19 
 
 		 499 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  32.59 
 
 		 457 aa  243  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  35.36 
 
 		 449 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  33.48 
 
 		 456 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  34.68 
 
 		 452 aa  233  5e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  31.45 
 
 		 454 aa  226  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  33.63 
 
 		 494 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  30.56 
 
 		 456 aa  219  6e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  34.14 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  32.53 
 
 		 492 aa  216  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  33.85 
 
 		 493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  33.85 
 
 		 493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  31.96 
 
 		 484 aa  209  6e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  32.46 
 
 		 494 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  32.24 
 
 		 490 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  32.24 
 
 		 578 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 494 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  31.66 
 
 		 493 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  34.47 
 
 		 458 aa  196  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  31.11 
 
 		 487 aa  193  7e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  31.64 
 
 		 498 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  31.19 
 
 		 532 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  31.29 
 
 		 498 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  31.29 
 
 		 498 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  29.61 
 
 		 464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  29.8 
 
 		 462 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  29.95 
 
 		 445 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  28.03 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  31.24 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  29.36 
 
 		 492 aa  169  8e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  30.67 
 
 		 463 aa  167  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  27.91 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  28 
 
 		 457 aa  144  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  23.94 
 
 		 510 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  25.55 
 
 		 495 aa  106  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  26.71 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  26.75 
 
 		 491 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  25.16 
 
 		 436 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  27.92 
 
 		 438 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  24.44 
 
 		 512 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  24.78 
 
 		 445 aa  98.2  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  25.81 
 
 		 625 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  24.94 
 
 		 459 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  27.55 
 
 		 496 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  23.93 
 
 		 592 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  25.64 
 
 		 565 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  28.29 
 
 		 435 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  28.6 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  25.38 
 
 		 619 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  30.12 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  30.86 
 
 		 352 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  26.96 
 
 		 496 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  25.22 
 
 		 624 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  26.32 
 
 		 465 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  25.54 
 
 		 616 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  25.05 
 
 		 619 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  22.53 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  22.53 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  26.11 
 
 		 657 aa  84  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  27.11 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  26.02 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  25.39 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  22.44 
 
 		 482 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  30.27 
 
 		 510 aa  80.1  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  22.88 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  23.55 
 
 		 478 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  26.05 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  22.87 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  24.89 
 
 		 492 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  22.7 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  23.13 
 
 		 478 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  26.86 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  23.68 
 
 		 628 aa  75.9  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  23.13 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  25.21 
 
 		 492 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  23.26 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  23.13 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  23.26 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  36.72 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  23.26 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  23.43 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  23.26 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  26.46 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  26.27 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  24.32 
 
 		 495 aa  73.2  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  22.98 
 
 		 487 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  21.68 
 
 		 528 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  22.77 
 
 		 490 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  23.92 
 
 		 496 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  23.93 
 
 		 435 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>