211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7453 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  100 
 
 
438 aa  866    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 
494 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  30.89 
 
 
456 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  32.26 
 
 
490 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  31.37 
 
 
532 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  32.31 
 
 
578 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  28.13 
 
 
492 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  32.31 
 
 
494 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  31.19 
 
 
462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  30.84 
 
 
493 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  30.09 
 
 
463 aa  134  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  33.83 
 
 
444 aa  133  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  29.87 
 
 
459 aa  132  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  29.72 
 
 
484 aa  130  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  29.87 
 
 
499 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  32.05 
 
 
493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  29.66 
 
 
498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  28.95 
 
 
498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  28.95 
 
 
498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  31.84 
 
 
493 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  31.84 
 
 
493 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  31.92 
 
 
492 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  29.24 
 
 
510 aa  126  9e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  27.38 
 
 
469 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  31.16 
 
 
449 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  30.97 
 
 
494 aa  124  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  30.14 
 
 
458 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  30.51 
 
 
447 aa  120  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  31.57 
 
 
450 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  31.57 
 
 
450 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  29.32 
 
 
463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  32.09 
 
 
446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  26.84 
 
 
456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  30.32 
 
 
465 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  32.89 
 
 
454 aa  107  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  26.05 
 
 
457 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  27.74 
 
 
452 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  25.55 
 
 
454 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  31.17 
 
 
439 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  25.73 
 
 
459 aa  98.2  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  25.43 
 
 
457 aa  92  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  26.2 
 
 
445 aa  91.7  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  28.99 
 
 
487 aa  90.9  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  28.83 
 
 
512 aa  85.9  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.57 
 
 
496 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  25.68 
 
 
624 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  24.72 
 
 
592 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  22.22 
 
 
464 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  23.08 
 
 
459 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  24.77 
 
 
625 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  26.92 
 
 
492 aa  79.7  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  22.92 
 
 
496 aa  79.7  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  24.66 
 
 
496 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  24.95 
 
 
495 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  23.08 
 
 
487 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  24.94 
 
 
616 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  24.55 
 
 
482 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  24.55 
 
 
482 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  25.17 
 
 
492 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  24.55 
 
 
487 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  24.25 
 
 
485 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  23.92 
 
 
619 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  23.92 
 
 
619 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  24.34 
 
 
469 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  22.13 
 
 
490 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  24.25 
 
 
482 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  24.44 
 
 
565 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  24.25 
 
 
490 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  23.95 
 
 
490 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  24.25 
 
 
487 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  57.69 
 
 
419 aa  70.1  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  21.78 
 
 
491 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  20.17 
 
 
478 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  20.17 
 
 
478 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  30.25 
 
 
439 aa  67  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  26.62 
 
 
435 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  22.14 
 
 
495 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  25.83 
 
 
537 aa  63.5  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  25.39 
 
 
427 aa  63.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  21.64 
 
 
495 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  26.32 
 
 
492 aa  61.6  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  24.29 
 
 
478 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  26.27 
 
 
478 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  39.24 
 
 
350 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  19.87 
 
 
478 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  30.47 
 
 
353 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  25.37 
 
 
352 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  20.22 
 
 
478 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  26.21 
 
 
431 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08359  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01470)  45.12 
 
 
378 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  23.4 
 
 
352 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  20.09 
 
 
478 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  20.09 
 
 
478 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  20.09 
 
 
478 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  22.15 
 
 
525 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.52 
 
 
499 aa  53.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  21.94 
 
 
528 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  55.1 
 
 
470 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  28.48 
 
 
543 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  64.29 
 
 
367 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>