183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2742 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  73.43 
 
 		 493 aa  739    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 490 aa  996    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  72.11 
 
 		 532 aa  729    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  71.17 
 
 		 494 aa  709    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  71.17 
 
 		 578 aa  710    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  71.17 
 
 		 494 aa  710    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  58.11 
 
 		 492 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  58.69 
 
 		 493 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  58.69 
 
 		 493 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  58.69 
 
 		 493 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  60.18 
 
 		 498 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  58.86 
 
 		 494 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  56.63 
 
 		 498 aa  531  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  56.63 
 
 		 498 aa  531  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  38.2 
 
 		 465 aa  257  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  36.48 
 
 		 459 aa  246  6.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  36.24 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  36.2 
 
 		 457 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  37.28 
 
 		 449 aa  232  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  37.01 
 
 		 499 aa  229  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  35.92 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  35.79 
 
 		 484 aa  220  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  37.39 
 
 		 454 aa  217  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  34.38 
 
 		 458 aa  216  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  32.75 
 
 		 456 aa  216  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  34.27 
 
 		 492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  35.38 
 
 		 450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  35.38 
 
 		 450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  34.42 
 
 		 446 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  31.49 
 
 		 454 aa  210  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  35.27 
 
 		 462 aa  207  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  35.65 
 
 		 463 aa  205  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  32.59 
 
 		 452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  34.81 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  36.36 
 
 		 463 aa  189  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  31.78 
 
 		 464 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  34.92 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  30.61 
 
 		 459 aa  180  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  32.99 
 
 		 510 aa  172  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  29.92 
 
 		 487 aa  159  7e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  28.73 
 
 		 469 aa  150  6e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  32.6 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  30.52 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  26.15 
 
 		 457 aa  126  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  27.62 
 
 		 492 aa  123  9e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  32.47 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  25.82 
 
 		 492 aa  107  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  31.25 
 
 		 352 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  30.65 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  28.1 
 
 		 435 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  25 
 
 		 480 aa  88.2  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  27.09 
 
 		 537 aa  86.7  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  26.83 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  28.39 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  26.3 
 
 		 479 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  30.63 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  28.28 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  29.33 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  27.35 
 
 		 431 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  28.54 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  25.92 
 
 		 465 aa  74.7  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  25.98 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  23.75 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.11 
 
 		 496 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  28.74 
 
 		 367 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  24.63 
 
 		 496 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  25.28 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  24.36 
 
 		 592 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4453  amine oxidase  26.65 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  28.85 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  27.73 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1377  amine oxidase  27.86 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  21.71 
 
 		 528 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  29.07 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  28.68 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  20.83 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  55.41 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  20.28 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  27.27 
 
 		 657 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  27.69 
 
 		 523 aa  63.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  23.06 
 
 		 423 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  23.42 
 
 		 565 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  27.65 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  22.47 
 
 		 625 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  28.31 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  38.54 
 
 		 496 aa  60.1  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  22.79 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3575  amine oxidase  26.69 
 
 		 529 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0911962  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  26.98 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  26.67 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  25.57 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  22.72 
 
 		 616 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0102  amine oxidase  28.9 
 
 		 547 aa  58.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  24.21 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  22.83 
 
 		 619 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  26.36 
 
 		 378 aa  56.6  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  23.35 
 
 		 490 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  22.62 
 
 		 619 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  23.8 
 
 		 624 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  25.6 
 
 		 442 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>