158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1418 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  100 
 
 		 396 aa  785    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0102  amine oxidase  49.1 
 
 		 547 aa  332  7.000000000000001e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  48.48 
 
 		 523 aa  328  7e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3575  amine oxidase  45.78 
 
 		 529 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0911962  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1737  amine oxidase  48.98 
 
 		 521 aa  315  9e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.821362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2164  putative amine oxidase  45.13 
 
 		 537 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  47.57 
 
 		 543 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  35.23 
 
 		 367 aa  196  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  35.42 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  32.99 
 
 		 381 aa  168  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  31.63 
 
 		 368 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  30.83 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  38.37 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  32.01 
 
 		 378 aa  162  8.000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  30.58 
 
 		 365 aa  160  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  32.14 
 
 		 352 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  32.45 
 
 		 387 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  32.45 
 
 		 387 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  26.48 
 
 		 350 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  28.39 
 
 		 353 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  30.33 
 
 		 349 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  30.33 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  30.33 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1377  amine oxidase  33.59 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00890  putative oxidoreductase protein  32.85 
 
 		 378 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0664967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  30.26 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1791  amine oxidase  29.43 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1970  amine oxidase  34.3 
 
 		 365 aa  116  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  25.12 
 
 		 423 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  39.82 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  40 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  42.31 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  44.71 
 
 		 450 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  44.71 
 
 		 450 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  28.31 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  21.56 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  28.73 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  28.85 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  38.6 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  33.33 
 
 		 494 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  40.96 
 
 		 465 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  37.37 
 
 		 498 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  37.37 
 
 		 498 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  36.84 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  36.56 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  43.21 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  30.06 
 
 		 479 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  37.36 
 
 		 444 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  42.53 
 
 		 449 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  26.15 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  24.12 
 
 		 494 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  29.52 
 
 		 498 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  44 
 
 		 456 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  24.12 
 
 		 578 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  24.12 
 
 		 494 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  36.84 
 
 		 492 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  44.59 
 
 		 447 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  27.78 
 
 		 493 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  39.77 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  32.22 
 
 		 487 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  27.43 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  27.43 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  23.38 
 
 		 456 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  38.37 
 
 		 445 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  33.78 
 
 		 493 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  34.18 
 
 		 464 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  31.9 
 
 		 492 aa  50.4  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  35.92 
 
 		 468 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  38.1 
 
 		 457 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  31.11 
 
 		 482 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  31.11 
 
 		 485 aa  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  31.11 
 
 		 482 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  31.11 
 
 		 482 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  31.11 
 
 		 487 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  31.11 
 
 		 490 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  31.11 
 
 		 487 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  27.56 
 
 		 445 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08162  amine oxidase, flavin-containing superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G01210)  40.91 
 
 		 473 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0766104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  31.11 
 
 		 490 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  34.04 
 
 		 510 aa  49.3  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  44.83 
 
 		 446 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2937  FAD dependent oxidoreductase  46.05 
 
 		 430 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187359  normal  0.0531334 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  42.86 
 
 		 454 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  31.11 
 
 		 490 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  24.07 
 
 		 469 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  39.29 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  23.71 
 
 		 497 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4072  amine oxidase  37.04 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.693433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  35.23 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  39.29 
 
 		 501 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1091  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein, flavin amine oxidase  44.74 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  40.74 
 
 		 448 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2754  amine oxidase  44.74 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5617  flavin-containing amine oxidase  38.46 
 
 		 432 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  35.11 
 
 		 512 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0462  FAD dependent oxidoreductase  41.33 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1250  amine oxidase  41.03 
 
 		 428 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00507419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1449  amine oxidase  37.35 
 
 		 434 aa  46.6  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  28.47 
 
 		 458 aa  47  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  47.06 
 
 		 470 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>