98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6444 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  100 
 
 		 387 aa  779    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  97.42 
 
 		 387 aa  736    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  68.11 
 
 		 387 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  68.11 
 
 		 387 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  64.69 
 
 		 382 aa  474  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  56.73 
 
 		 381 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  55.26 
 
 		 378 aa  420  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_003296  RS00890  putative oxidoreductase protein  53.58 
 
 		 378 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0664967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1377  amine oxidase  54.96 
 
 		 382 aa  398  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  44.54 
 
 		 367 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  40.64 
 
 		 365 aa  247  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  41 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  39.89 
 
 		 368 aa  236  7e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  36.41 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  30.92 
 
 		 423 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1970  amine oxidase  41.49 
 
 		 365 aa  180  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  38.29 
 
 		 523 aa  179  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  35.6 
 
 		 543 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2164  putative amine oxidase  34.7 
 
 		 537 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1791  amine oxidase  31.83 
 
 		 371 aa  166  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0102  amine oxidase  36.09 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1737  amine oxidase  35.46 
 
 		 521 aa  161  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.821362 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3575  amine oxidase  33.61 
 
 		 529 aa  158  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0911962  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  31.04 
 
 		 350 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  32.03 
 
 		 396 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  34.25 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  29.23 
 
 		 349 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  31.21 
 
 		 352 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  27.22 
 
 		 353 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  34.47 
 
 		 465 aa  79.7  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  26.03 
 
 		 532 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  31.91 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  32.82 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  30.77 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  30.77 
 
 		 493 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  30.77 
 
 		 493 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  28.11 
 
 		 445 aa  66.2  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 494 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  29.06 
 
 		 578 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  28.68 
 
 		 494 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  31.51 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  26.91 
 
 		 490 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  27.39 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  28.51 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  26.24 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  30.28 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  29.07 
 
 		 447 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  24.45 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  30.17 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  27.55 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  32.48 
 
 		 494 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  28.35 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  32.31 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  32.31 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  32.31 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  26.87 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  27.13 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  27.76 
 
 		 458 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  25.54 
 
 		 484 aa  54.3  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3819  cyclohexanone monooxygenase  37.74 
 
 		 527 aa  53.9  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  28.86 
 
 		 444 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  26.94 
 
 		 512 aa  53.5  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  29.74 
 
 		 456 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  29.56 
 
 		 427 aa  53.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  28.92 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  25.95 
 
 		 487 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  58.14 
 
 		 557 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  29.13 
 
 		 510 aa  50.4  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  28.4 
 
 		 454 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  35.87 
 
 		 723 aa  49.7  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  31.47 
 
 		 498 aa  49.7  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  31.47 
 
 		 498 aa  49.7  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  60.98 
 
 		 562 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  28.74 
 
 		 463 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  59.09 
 
 		 563 aa  47  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  25.65 
 
 		 459 aa  46.6  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  40 
 
 		 488 aa  46.6  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  35.24 
 
 		 492 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  37.84 
 
 		 496 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  36.94 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  31.13 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  36.08 
 
 		 499 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  27.66 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0043  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  37.89 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  34.78 
 
 		 501 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4724  amine oxidase  54.76 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  33.33 
 
 		 525 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2502  amine oxidase  48.89 
 
 		 557 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1239  FAD dependent oxidoreductase  44.26 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0355742  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0112  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 		 487 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0699636 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0615  cyclohexanone monooxygenase  36.59 
 
 		 489 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  24.7 
 
 		 481 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  37.84 
 
 		 494 aa  43.5  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  52.5 
 
 		 399 aa  43.5  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0490  amine oxidase:FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 439 aa  43.1  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.599363  normal  0.908175 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  24.63 
 
 		 488 aa  42.7  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  50 
 
 		 492 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>