159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1970 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1970  amine oxidase  100 
 
 		 365 aa  696    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  44.96 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  44.93 
 
 		 382 aa  245  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  40.39 
 
 		 365 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  40.61 
 
 		 387 aa  227  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  40.61 
 
 		 387 aa  227  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  39.49 
 
 		 361 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00890  putative oxidoreductase protein  39.18 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0664967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1377  amine oxidase  40.72 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  39.66 
 
 		 378 aa  217  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  40.55 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  37.33 
 
 		 368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  40.77 
 
 		 387 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  38.35 
 
 		 381 aa  209  6e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  42.2 
 
 		 367 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  41.46 
 
 		 523 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0102  amine oxidase  38.59 
 
 		 547 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  40.06 
 
 		 543 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3575  amine oxidase  36.97 
 
 		 529 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0911962  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1737  amine oxidase  38.98 
 
 		 521 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.821362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2164  putative amine oxidase  35.98 
 
 		 537 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1791  amine oxidase  33.7 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  35.16 
 
 		 396 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  35.11 
 
 		 352 aa  145  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  28.99 
 
 		 423 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  29.41 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  33.14 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  29.66 
 
 		 349 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  28.09 
 
 		 353 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  36.47 
 
 		 465 aa  93.2  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  33.74 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  32.02 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  31.69 
 
 		 532 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  31.91 
 
 		 487 aa  80.5  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  30.8 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  30.4 
 
 		 578 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 494 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  27.2 
 
 		 469 aa  76.3  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  31.97 
 
 		 493 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  28.36 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  29.23 
 
 		 493 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  29.23 
 
 		 493 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  29.23 
 
 		 493 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  34.39 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  31.28 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  42.31 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  28.2 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  30.49 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  30.04 
 
 		 490 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  26.95 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  28.57 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  31.56 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  29.57 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  27.02 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  31.6 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  30.92 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  27.9 
 
 		 498 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  42.31 
 
 		 492 aa  62.8  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  29.22 
 
 		 462 aa  62.8  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  27.34 
 
 		 456 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  34.01 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  28.23 
 
 		 592 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  32.78 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  29.58 
 
 		 512 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  34.01 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  34.01 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  27.3 
 
 		 625 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  29.48 
 
 		 494 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  30.46 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  27.08 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  36 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  27.05 
 
 		 624 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  27.02 
 
 		 616 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  28.84 
 
 		 510 aa  54.7  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  44.23 
 
 		 491 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  53.7 
 
 		 445 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  26.61 
 
 		 619 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  26.1 
 
 		 619 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  40.4 
 
 		 492 aa  53.5  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  27.82 
 
 		 496 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  26.61 
 
 		 496 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  51.85 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  27.31 
 
 		 565 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  21.39 
 
 		 445 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  28 
 
 		 491 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  47.27 
 
 		 479 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  52.94 
 
 		 433 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  27.13 
 
 		 495 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  35.92 
 
 		 504 aa  49.7  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  41.07 
 
 		 495 aa  49.7  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  38.71 
 
 		 499 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  37.66 
 
 		 493 aa  49.7  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  39.29 
 
 		 537 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  33.33 
 
 		 498 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  39.74 
 
 		 431 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  33.33 
 
 		 498 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 		 536 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  38.67 
 
 		 492 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  39.62 
 
 		 505 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  38.18 
 
 		 493 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>