189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0841 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  100 
 
 		 378 aa  778    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  81.63 
 
 		 381 aa  645    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  57.1 
 
 		 387 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  57.1 
 
 		 387 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  55.8 
 
 		 387 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  55.26 
 
 		 387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  55.43 
 
 		 382 aa  395  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1377  amine oxidase  50.4 
 
 		 382 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00890  putative oxidoreductase protein  50.13 
 
 		 378 aa  358  8e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0664967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  43.23 
 
 		 367 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  41.26 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  40.11 
 
 		 368 aa  262  6.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  38.24 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  39.5 
 
 		 361 aa  229  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0102  amine oxidase  36.9 
 
 		 547 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3575  amine oxidase  35.96 
 
 		 529 aa  193  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0911962  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1737  amine oxidase  35.56 
 
 		 521 aa  193  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.821362 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1791  amine oxidase  34.91 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2164  putative amine oxidase  36.06 
 
 		 537 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  31.84 
 
 		 423 aa  190  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  34.72 
 
 		 523 aa  186  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  34.37 
 
 		 543 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1970  amine oxidase  39.02 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  31.75 
 
 		 396 aa  155  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  31.73 
 
 		 350 aa  152  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  34.2 
 
 		 352 aa  149  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  30.55 
 
 		 353 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  31.99 
 
 		 349 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  32.63 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  29.73 
 
 		 465 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  28.57 
 
 		 449 aa  69.7  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  24.11 
 
 		 457 aa  67  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  29.3 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  29.3 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  29.3 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  28.52 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  29.76 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  26.95 
 
 		 462 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  26.52 
 
 		 459 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  26.29 
 
 		 498 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  25.73 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  29.41 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  25.97 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  28.26 
 
 		 446 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  27.86 
 
 		 493 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  26.3 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  27.68 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  32.39 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  34.21 
 
 		 624 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  26.64 
 
 		 532 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  26.36 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  37.78 
 
 		 494 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  27.38 
 
 		 469 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  27.57 
 
 		 450 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  27.57 
 
 		 450 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  27.57 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  25.42 
 
 		 492 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  43.75 
 
 		 468 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  27.31 
 
 		 454 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  32.76 
 
 		 625 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  44.59 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  27.23 
 
 		 457 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  26.89 
 
 		 445 aa  53.1  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  36.26 
 
 		 499 aa  53.1  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  35.35 
 
 		 599 aa  53.1  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  39.24 
 
 		 647 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  28.3 
 
 		 510 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  39.24 
 
 		 647 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  44.44 
 
 		 542 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  40.74 
 
 		 592 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  40.26 
 
 		 645 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  25.17 
 
 		 456 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  30.56 
 
 		 493 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  27.59 
 
 		 512 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  49.18 
 
 		 465 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  28.22 
 
 		 463 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  40.98 
 
 		 488 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  37.78 
 
 		 471 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  26.97 
 
 		 479 aa  50.4  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  26.56 
 
 		 578 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 494 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  26.56 
 
 		 494 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  30.43 
 
 		 494 aa  49.7  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  37.04 
 
 		 647 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  40.85 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  47.27 
 
 		 497 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  32.97 
 
 		 454 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2937  FAD dependent oxidoreductase  39.08 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187359  normal  0.0531334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  26.69 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09230  conserved hypothetical protein  28.48 
 
 		 566 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  33.33 
 
 		 498 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  33.33 
 
 		 498 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  37.35 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  39.74 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  28.21 
 
 		 530 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  43.08 
 
 		 488 aa  47.8  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0273  amine oxidase  32.74 
 
 		 449 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  37.36 
 
 		 496 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  48.21 
 
 		 548 aa  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  37.5 
 
 		 496 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>