101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6151 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  97.42 
 
 		 387 aa  736    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  100 
 
 		 387 aa  780    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  68.65 
 
 		 387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  68.65 
 
 		 387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  64.96 
 
 		 382 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  57.03 
 
 		 381 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  55.8 
 
 		 378 aa  423  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_003296  RS00890  putative oxidoreductase protein  53.79 
 
 		 378 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0664967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1377  amine oxidase  54.96 
 
 		 382 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  44.54 
 
 		 367 aa  281  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  40.37 
 
 		 365 aa  250  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  40.72 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  38.83 
 
 		 368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  37.33 
 
 		 361 aa  199  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  30.22 
 
 		 423 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1970  amine oxidase  41.49 
 
 		 365 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  38.12 
 
 		 523 aa  179  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1791  amine oxidase  33.6 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  35.68 
 
 		 543 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2164  putative amine oxidase  35.16 
 
 		 537 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1737  amine oxidase  35.73 
 
 		 521 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.821362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0102  amine oxidase  35.44 
 
 		 547 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3575  amine oxidase  34.17 
 
 		 529 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0911962  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  31.09 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  33.42 
 
 		 352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  32.03 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  30.6 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  32.37 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  27.27 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  35.09 
 
 		 465 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  26.78 
 
 		 532 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  32.46 
 
 		 449 aa  79.3  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  30.83 
 
 		 493 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  28.86 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  25.06 
 
 		 498 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  30.77 
 
 		 493 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  30.77 
 
 		 493 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  30.77 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  29.06 
 
 		 578 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 494 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  28.68 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  30.15 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  26.79 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  30.28 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  28.51 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  26.24 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  28.08 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  26.75 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  33.12 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  27.55 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  30.17 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  25.9 
 
 		 484 aa  57  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  28.68 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  27.49 
 
 		 463 aa  57  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  26.87 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  30.38 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  30.38 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  30.38 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  28.29 
 
 		 456 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3819  cyclohexanone monooxygenase  37.74 
 
 		 527 aa  53.5  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  28.14 
 
 		 458 aa  53.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  28.46 
 
 		 444 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  28.92 
 
 		 459 aa  53.1  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  24.63 
 
 		 487 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  29.56 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  29.17 
 
 		 512 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  58.14 
 
 		 557 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  28.74 
 
 		 463 aa  50.4  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  30.94 
 
 		 498 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  31.21 
 
 		 510 aa  50.1  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  30.94 
 
 		 498 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  29.27 
 
 		 454 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  34.74 
 
 		 723 aa  49.7  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  61.54 
 
 		 562 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  40 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  59.09 
 
 		 563 aa  47  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  36.23 
 
 		 501 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  26.02 
 
 		 459 aa  46.6  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  31.36 
 
 		 492 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  26.49 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  37.89 
 
 		 468 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  34.38 
 
 		 525 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  24.26 
 
 		 481 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  38.57 
 
 		 493 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  31.13 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0043  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34 
 
 		 487 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0490  amine oxidase:FAD dependent oxidoreductase  47.54 
 
 		 439 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.599363  normal  0.908175 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  36.11 
 
 		 488 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2502  amine oxidase  48.89 
 
 		 557 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4724  amine oxidase  37.21 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4373  flavin-containing monooxygenase  31.86 
 
 		 446 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  38.36 
 
 		 494 aa  43.9  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  36.04 
 
 		 478 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0112  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 		 487 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0699636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  37.89 
 
 		 499 aa  43.5  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  38.89 
 
 		 548 aa  43.5  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  32.8 
 
 		 388 aa  43.1  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2048  flavin-containing monooxygenase FMO  46.15 
 
 		 484 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  52.5 
 
 		 399 aa  43.1  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4072  amine oxidase  34.09 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.693433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>