108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1006 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  100 
 
 		 387 aa  788    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  100 
 
 		 387 aa  788    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  68.65 
 
 		 387 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  68.11 
 
 		 387 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  57.8 
 
 		 381 aa  455  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  57.1 
 
 		 378 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  60.92 
 
 		 382 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1377  amine oxidase  54.47 
 
 		 382 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00890  putative oxidoreductase protein  53.1 
 
 		 378 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0664967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  43.54 
 
 		 367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  39.13 
 
 		 365 aa  268  8.999999999999999e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  41.27 
 
 		 367 aa  254  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  38.84 
 
 		 368 aa  232  7.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  31.59 
 
 		 423 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  33.78 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1970  amine oxidase  39.71 
 
 		 365 aa  184  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2164  putative amine oxidase  36.46 
 
 		 537 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0102  amine oxidase  35.84 
 
 		 547 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1791  amine oxidase  32.53 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  35.97 
 
 		 523 aa  169  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  35.12 
 
 		 543 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3575  amine oxidase  33.7 
 
 		 529 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0911962  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1737  amine oxidase  34.07 
 
 		 521 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.821362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  33.33 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  29.05 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  30.13 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  28.14 
 
 		 353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  33.24 
 
 		 352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  29.83 
 
 		 349 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  34.77 
 
 		 465 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  32.13 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  29.07 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  33.68 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  28.63 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  31.73 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  28.07 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  25.33 
 
 		 498 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  32.94 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  33.82 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  31.72 
 
 		 532 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  28.51 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  26.75 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  39.8 
 
 		 493 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  39.8 
 
 		 493 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  39.8 
 
 		 493 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  31.14 
 
 		 447 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  30.89 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  26.61 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  27.96 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  29.22 
 
 		 452 aa  57  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  27.27 
 
 		 492 aa  56.2  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  26.34 
 
 		 457 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  33.72 
 
 		 439 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  36.54 
 
 		 498 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  29.63 
 
 		 510 aa  55.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  36.54 
 
 		 498 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  33.33 
 
 		 450 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  33.33 
 
 		 450 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  27.49 
 
 		 457 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  29.82 
 
 		 454 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  29.95 
 
 		 512 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  27.13 
 
 		 490 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 494 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  29.95 
 
 		 578 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  34.23 
 
 		 494 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  26.02 
 
 		 484 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  25.24 
 
 		 435 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  37.78 
 
 		 494 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  27.41 
 
 		 463 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  27.51 
 
 		 459 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  35.29 
 
 		 451 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  24.91 
 
 		 487 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  26.32 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0043  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.08 
 
 		 487 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  58.54 
 
 		 562 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  34.09 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  25.34 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  31.58 
 
 		 723 aa  47  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  25.41 
 
 		 479 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  32.05 
 
 		 438 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  34.78 
 
 		 548 aa  46.6  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  28.19 
 
 		 494 aa  46.6  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  53.49 
 
 		 557 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  25.48 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  36.27 
 
 		 472 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  36.76 
 
 		 497 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  38.46 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  30.36 
 
 		 492 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  38.3 
 
 		 436 aa  44.3  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  54.55 
 
 		 478 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  26.4 
 
 		 464 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  52.27 
 
 		 478 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  37.65 
 
 		 525 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1568  twin-arginine translocation pathway signal  51.06 
 
 		 536 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  33.33 
 
 		 533 aa  43.5  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  37.08 
 
 		 455 aa  43.5  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3819  cyclohexanone monooxygenase  31.58 
 
 		 527 aa  43.5  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  30.92 
 
 		 520 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4430  flavin-containing monooxygenase FMO  56.76 
 
 		 487 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0263565  normal  0.618876 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  34.07 
 
 		 519 aa  43.1  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>