129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57813 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  100 
 
 		 494 aa  1018    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28515  corticosteroid- binding protein  34.3 
 
 		 477 aa  241  2e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  28.36 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  28.31 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  28.14 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  26.31 
 
 		 479 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  27.25 
 
 		 495 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  27.66 
 
 		 495 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  25.19 
 
 		 657 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  26.38 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  24.59 
 
 		 628 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  25.7 
 
 		 481 aa  96.7  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  26.08 
 
 		 466 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  25.15 
 
 		 1199 aa  88.6  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  27.31 
 
 		 1274 aa  88.6  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  23.34 
 
 		 463 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48603  flavin-containing amine oxidase  24.14 
 
 		 600 aa  82.4  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.871635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  23.62 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  25.3 
 
 		 470 aa  79.7  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  22.57 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  24.48 
 
 		 470 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  22.01 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  21.88 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  24.27 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  24.61 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  22.31 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  25.1 
 
 		 999 aa  60.5  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  22.85 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  22.97 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  22.18 
 
 		 536 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  34.26 
 
 		 464 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  22.08 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  21.9 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  40.45 
 
 		 577 aa  58.2  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  23.17 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  21.04 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  22.25 
 
 		 485 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  20.91 
 
 		 450 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  22.15 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  22.7 
 
 		 444 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  46.15 
 
 		 367 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  23.44 
 
 		 436 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  23.29 
 
 		 418 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  50 
 
 		 543 aa  53.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  21.86 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  21.53 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  21.51 
 
 		 482 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  33.01 
 
 		 427 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  47.83 
 
 		 498 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  22.46 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  46.15 
 
 		 498 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  46.15 
 
 		 498 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  20.92 
 
 		 487 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  47.83 
 
 		 492 aa  50.8  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  20.92 
 
 		 482 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  20.92 
 
 		 482 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  38.27 
 
 		 349 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  36.54 
 
 		 492 aa  50.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  30.43 
 
 		 378 aa  49.7  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  22.78 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  41.94 
 
 		 523 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  20.43 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  37.21 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  22.36 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  21.44 
 
 		 490 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  21.36 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  24.2 
 
 		 407 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  33.65 
 
 		 353 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  21.16 
 
 		 490 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  20.96 
 
 		 485 aa  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  23.15 
 
 		 537 aa  48.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  47.62 
 
 		 352 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  23.25 
 
 		 427 aa  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5079  hypothetical protein  39.44 
 
 		 687 aa  47.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326804 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  21.46 
 
 		 490 aa  47.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2164  putative amine oxidase  34.94 
 
 		 537 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  48.94 
 
 		 476 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  41.67 
 
 		 350 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  22.45 
 
 		 422 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  39.68 
 
 		 478 aa  47  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  39.68 
 
 		 478 aa  47  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  45.31 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  33.66 
 
 		 492 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  45.16 
 
 		 456 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  28.19 
 
 		 387 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  28.19 
 
 		 387 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  36.17 
 
 		 532 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2287  methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 688 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245071  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3456  methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 698 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0101492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3193  methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 689 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.212638  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  20.99 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  46.05 
 
 		 447 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  37.97 
 
 		 329 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  22.69 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  21.95 
 
 		 459 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3685  amine oxidase  38.03 
 
 		 687 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  22.62 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  46.67 
 
 		 578 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  49.12 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  49.12 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>