26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3456 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3685  amine oxidase  81.58 
 
 		 687 aa  1199    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336746  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2287  methyltransferase type 11  82.23 
 
 		 688 aa  1194    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245071  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3456  methyltransferase type 11  100 
 
 		 698 aa  1451    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0101492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3193  methyltransferase type 11  81.54 
 
 		 689 aa  1193    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.212638  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1533  amine oxidase  77.24 
 
 		 682 aa  1124    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.799563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5079  hypothetical protein  81.11 
 
 		 687 aa  1173    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1545  amine oxidase  41.01 
 
 		 732 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 810 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 252 aa  52  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 276 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  21.45 
 
 		 464 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2502  amine oxidase  22.87 
 
 		 557 aa  48.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  24.92 
 
 		 473 aa  47.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  21.41 
 
 		 478 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  21.41 
 
 		 478 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2889  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  35 
 
 		 496 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.693571  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  39.76 
 
 		 349 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  35.9 
 
 		 494 aa  45.8  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3571  amine oxidase  34 
 
 		 461 aa  45.8  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.689303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  19.9 
 
 		 454 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.46 
 
 		 255 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 215 aa  45.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  23.97 
 
 		 296 aa  45.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  27.27 
 
 		 783 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_41  SAM dependent methyltransferase, UbiE family  32.65 
 
 		 202 aa  44.3  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000057615  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  52.38 
 
 		 482 aa  44.3  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>